Protein–RNA interactions for Protein: Q8CF31

Uncharacterized protein C11orf94 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 99 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8CF31 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Q8CF31 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Q8CF31 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Q8CF31 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Q8CF31 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Q8CF31 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Q8CF31 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Q8CF31 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Q8CF31 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Q8CF31 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Q8CF31 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Q8CF31 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Q8CF31 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Q8CF31 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Q8CF31 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Q8CF31 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Q8CF31 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Q8CF31 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Q8CF31 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Q8CF31 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Q8CF31 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Q8CF31 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Q8CF31 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Q8CF31 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Q8CF31 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Q8CF31 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Q8CF31 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Q8CF31 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Q8CF31 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Q8CF31 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Q8CF31 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Q8CF31 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Q8CF31 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Q8CF31 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Q8CF31 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Q8CF31 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Q8CF31 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Q8CF31 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Q8CF31 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Q8CF31 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Q8CF31 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Q8CF31 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Q8CF31 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Q8CF31 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Q8CF31 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Q8CF31 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Q8CF31 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Q8CF31 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Q8CF31 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Q8CF31 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Q8CF31 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Q8CF31 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Q8CF31 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Q8CF31 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Q8CF31 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Q8CF31 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Q8CF31 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Q8CF31 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Q8CF31 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Q8CF31 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Q8CF31 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Q8CF31 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Q8CF31 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Q8CF31 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Q8CF31 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Q8CF31 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Q8CF31 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Q8CF31 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Q8CF31 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Q8CF31 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Q8CF31 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Q8CF31 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Q8CF31 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Q8CF31 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Q8CF31 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Q8CF31 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Q8CF31 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Q8CF31 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Q8CF31 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Q8CF31 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Q8CF31 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Q8CF31 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Q8CF31 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Q8CF31 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Q8CF31 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Q8CF31 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Q8CF31 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Q8CF31 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Q8CF31 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Q8CF31 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Q8CF31 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Q8CF31 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Q8CF31 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Q8CF31 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Q8CF31 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Q8CF31 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Q8CF31 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Q8CF31 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Q8CF31 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Q8CF31 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.6 ms