Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDN8

Ccdc38, Coiled-coil domain-containing protein 38, mousemouse

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc38Q8CDN8 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
Ccdc38Q8CDN8 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Ccdc38Q8CDN8 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Ccdc38Q8CDN8 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Ccdc38Q8CDN8 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Ccdc38Q8CDN8 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Ccdc38Q8CDN8 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Ccdc38Q8CDN8 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Ccdc38Q8CDN8 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Ccdc38Q8CDN8 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Ccdc38Q8CDN8 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Ccdc38Q8CDN8 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Ccdc38Q8CDN8 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Ccdc38Q8CDN8 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Ccdc38Q8CDN8 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Ccdc38Q8CDN8 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Ccdc38Q8CDN8 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Ccdc38Q8CDN8 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Ccdc38Q8CDN8 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Ccdc38Q8CDN8 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Ccdc38Q8CDN8 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Ccdc38Q8CDN8 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Ccdc38Q8CDN8 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Ccdc38Q8CDN8 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Ccdc38Q8CDN8 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Ccdc38Q8CDN8 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Ccdc38Q8CDN8 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.76
Ccdc38Q8CDN8 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Ccdc38Q8CDN8 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Ccdc38Q8CDN8 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Ccdc38Q8CDN8 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Ccdc38Q8CDN8 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Ccdc38Q8CDN8 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Ccdc38Q8CDN8 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Ccdc38Q8CDN8 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Ccdc38Q8CDN8 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Ccdc38Q8CDN8 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Ccdc38Q8CDN8 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Ccdc38Q8CDN8 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Ccdc38Q8CDN8 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Ccdc38Q8CDN8 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ccdc38Q8CDN8 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.76
Ccdc38Q8CDN8 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Ccdc38Q8CDN8 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Ccdc38Q8CDN8 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Ccdc38Q8CDN8 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Ccdc38Q8CDN8 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Ccdc38Q8CDN8 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Ccdc38Q8CDN8 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Ccdc38Q8CDN8 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Ccdc38Q8CDN8 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Ccdc38Q8CDN8 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
Ccdc38Q8CDN8 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
Ccdc38Q8CDN8 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Ccdc38Q8CDN8 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Ccdc38Q8CDN8 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ccdc38Q8CDN8 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ccdc38Q8CDN8 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Ccdc38Q8CDN8 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Ccdc38Q8CDN8 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Ccdc38Q8CDN8 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Ccdc38Q8CDN8 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Ccdc38Q8CDN8 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Ccdc38Q8CDN8 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Ccdc38Q8CDN8 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Ccdc38Q8CDN8 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Ccdc38Q8CDN8 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Ccdc38Q8CDN8 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Ccdc38Q8CDN8 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Ccdc38Q8CDN8 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Ccdc38Q8CDN8 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Ccdc38Q8CDN8 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Ccdc38Q8CDN8 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Ccdc38Q8CDN8 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
Ccdc38Q8CDN8 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Ccdc38Q8CDN8 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Ccdc38Q8CDN8 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Ccdc38Q8CDN8 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Ccdc38Q8CDN8 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Ccdc38Q8CDN8 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Ccdc38Q8CDN8 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Ccdc38Q8CDN8 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Ccdc38Q8CDN8 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Ccdc38Q8CDN8 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Ccdc38Q8CDN8 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Ccdc38Q8CDN8 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Ccdc38Q8CDN8 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Ccdc38Q8CDN8 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC25.89■■□□□ 1.73
Ccdc38Q8CDN8 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Ccdc38Q8CDN8 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Ccdc38Q8CDN8 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Ccdc38Q8CDN8 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Ccdc38Q8CDN8 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Ccdc38Q8CDN8 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Ccdc38Q8CDN8 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Ccdc38Q8CDN8 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Ccdc38Q8CDN8 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Ccdc38Q8CDN8 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Ccdc38Q8CDN8 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
Ccdc38Q8CDN8 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.1 ms