Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDL9

Ccdc87, Coiled-coil domain-containing protein 87, mousemouse

Predictions only

Length 855 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc87Q8CDL9 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ccdc87Q8CDL9 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Ccdc87Q8CDL9 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Ccdc87Q8CDL9 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Ccdc87Q8CDL9 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ccdc87Q8CDL9 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ccdc87Q8CDL9 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ccdc87Q8CDL9 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ccdc87Q8CDL9 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ccdc87Q8CDL9 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ccdc87Q8CDL9 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ccdc87Q8CDL9 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ccdc87Q8CDL9 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ccdc87Q8CDL9 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Ccdc87Q8CDL9 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ccdc87Q8CDL9 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ccdc87Q8CDL9 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ccdc87Q8CDL9 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ccdc87Q8CDL9 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ccdc87Q8CDL9 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ccdc87Q8CDL9 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ccdc87Q8CDL9 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Ccdc87Q8CDL9 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ccdc87Q8CDL9 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ccdc87Q8CDL9 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ccdc87Q8CDL9 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ccdc87Q8CDL9 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ccdc87Q8CDL9 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ccdc87Q8CDL9 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ccdc87Q8CDL9 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ccdc87Q8CDL9 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ccdc87Q8CDL9 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ccdc87Q8CDL9 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ccdc87Q8CDL9 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ccdc87Q8CDL9 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ccdc87Q8CDL9 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ccdc87Q8CDL9 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Ccdc87Q8CDL9 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ccdc87Q8CDL9 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ccdc87Q8CDL9 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ccdc87Q8CDL9 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ccdc87Q8CDL9 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ccdc87Q8CDL9 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ccdc87Q8CDL9 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ccdc87Q8CDL9 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ccdc87Q8CDL9 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ccdc87Q8CDL9 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ccdc87Q8CDL9 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ccdc87Q8CDL9 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ccdc87Q8CDL9 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ccdc87Q8CDL9 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ccdc87Q8CDL9 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ccdc87Q8CDL9 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ccdc87Q8CDL9 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ccdc87Q8CDL9 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ccdc87Q8CDL9 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ccdc87Q8CDL9 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ccdc87Q8CDL9 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ccdc87Q8CDL9 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ccdc87Q8CDL9 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ccdc87Q8CDL9 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ccdc87Q8CDL9 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ccdc87Q8CDL9 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Ccdc87Q8CDL9 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ccdc87Q8CDL9 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ccdc87Q8CDL9 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ccdc87Q8CDL9 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ccdc87Q8CDL9 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ccdc87Q8CDL9 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ccdc87Q8CDL9 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ccdc87Q8CDL9 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ccdc87Q8CDL9 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ccdc87Q8CDL9 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ccdc87Q8CDL9 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ccdc87Q8CDL9 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ccdc87Q8CDL9 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ccdc87Q8CDL9 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ccdc87Q8CDL9 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ccdc87Q8CDL9 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ccdc87Q8CDL9 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ccdc87Q8CDL9 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Ccdc87Q8CDL9 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Ccdc87Q8CDL9 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ccdc87Q8CDL9 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ccdc87Q8CDL9 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ccdc87Q8CDL9 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Ccdc87Q8CDL9 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ccdc87Q8CDL9 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ccdc87Q8CDL9 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ccdc87Q8CDL9 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ccdc87Q8CDL9 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ccdc87Q8CDL9 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ccdc87Q8CDL9 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ccdc87Q8CDL9 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ccdc87Q8CDL9 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ccdc87Q8CDL9 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ccdc87Q8CDL9 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ccdc87Q8CDL9 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ccdc87Q8CDL9 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ccdc87Q8CDL9 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 136.6 ms