Protein–RNA interactions for Protein: Q8C9W1

A430089I19Rik, RIKEN cDNA A430089I19 gene, mousemouse

Predictions only

Length 407 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A430089I19RikQ8C9W1 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24,87■■□□□ 1,57
A430089I19RikQ8C9W1 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC24,87■■□□□ 1,57
A430089I19RikQ8C9W1 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24,86■■□□□ 1,57
A430089I19RikQ8C9W1 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC24,86■■□□□ 1,57
A430089I19RikQ8C9W1 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,86■■□□□ 1,57
A430089I19RikQ8C9W1 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24,85■■□□□ 1,57
A430089I19RikQ8C9W1 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24,85■■□□□ 1,57
A430089I19RikQ8C9W1 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC24,84■■□□□ 1,57
A430089I19RikQ8C9W1 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,83■■□□□ 1,57
A430089I19RikQ8C9W1 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC24,83■■□□□ 1,57
A430089I19RikQ8C9W1 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24,83■■□□□ 1,57
A430089I19RikQ8C9W1 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC24,82■■□□□ 1,56
A430089I19RikQ8C9W1 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,82■■□□□ 1,56
A430089I19RikQ8C9W1 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24,81■■□□□ 1,56
A430089I19RikQ8C9W1 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,81■■□□□ 1,56
A430089I19RikQ8C9W1 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC24,81■■□□□ 1,56
A430089I19RikQ8C9W1 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,81■■□□□ 1,56
A430089I19RikQ8C9W1 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC24,81■■□□□ 1,56
A430089I19RikQ8C9W1 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,81■■□□□ 1,56
A430089I19RikQ8C9W1 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24,81■■□□□ 1,56
A430089I19RikQ8C9W1 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24,8■■□□□ 1,56
A430089I19RikQ8C9W1 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24,8■■□□□ 1,56
A430089I19RikQ8C9W1 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,79■■□□□ 1,56
A430089I19RikQ8C9W1 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,78■■□□□ 1,56
A430089I19RikQ8C9W1 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,78■■□□□ 1,56
A430089I19RikQ8C9W1 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24,77■■□□□ 1,56
A430089I19RikQ8C9W1 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,77■■□□□ 1,56
A430089I19RikQ8C9W1 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,76■■□□□ 1,55
A430089I19RikQ8C9W1 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC24,76■■□□□ 1,55
A430089I19RikQ8C9W1 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,75■■□□□ 1,55
A430089I19RikQ8C9W1 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,75■■□□□ 1,55
A430089I19RikQ8C9W1 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24,74■■□□□ 1,55
A430089I19RikQ8C9W1 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC24,74■■□□□ 1,55
A430089I19RikQ8C9W1 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24,74■■□□□ 1,55
A430089I19RikQ8C9W1 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,74■■□□□ 1,55
A430089I19RikQ8C9W1 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24,73■■□□□ 1,55
A430089I19RikQ8C9W1 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,73■■□□□ 1,55
A430089I19RikQ8C9W1 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,73■■□□□ 1,55
A430089I19RikQ8C9W1 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC24,73■■□□□ 1,55
A430089I19RikQ8C9W1 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24,72■■□□□ 1,55
A430089I19RikQ8C9W1 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC24,72■■□□□ 1,55
A430089I19RikQ8C9W1 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24,71■■□□□ 1,55
A430089I19RikQ8C9W1 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,71■■□□□ 1,55
A430089I19RikQ8C9W1 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,71■■□□□ 1,55
A430089I19RikQ8C9W1 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,7■■□□□ 1,55
A430089I19RikQ8C9W1 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,7■■□□□ 1,54
A430089I19RikQ8C9W1 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24,69■■□□□ 1,54
A430089I19RikQ8C9W1 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,68■■□□□ 1,54
A430089I19RikQ8C9W1 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24,68■■□□□ 1,54
A430089I19RikQ8C9W1 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC24,68■■□□□ 1,54
A430089I19RikQ8C9W1 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC24,68■■□□□ 1,54
A430089I19RikQ8C9W1 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,67■■□□□ 1,54
A430089I19RikQ8C9W1 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,67■■□□□ 1,54
A430089I19RikQ8C9W1 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,67■■□□□ 1,54
A430089I19RikQ8C9W1 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,67■■□□□ 1,54
A430089I19RikQ8C9W1 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24,67■■□□□ 1,54
A430089I19RikQ8C9W1 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,67■■□□□ 1,54
A430089I19RikQ8C9W1 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,66■■□□□ 1,54
A430089I19RikQ8C9W1 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC24,66■■□□□ 1,54
A430089I19RikQ8C9W1 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC24,66■■□□□ 1,54
A430089I19RikQ8C9W1 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC24,66■■□□□ 1,54
A430089I19RikQ8C9W1 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC24,66■■□□□ 1,54
A430089I19RikQ8C9W1 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC24,65■■□□□ 1,54
A430089I19RikQ8C9W1 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC24,65■■□□□ 1,54
A430089I19RikQ8C9W1 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24,64■■□□□ 1,54
A430089I19RikQ8C9W1 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,63■■□□□ 1,53
A430089I19RikQ8C9W1 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,63■■□□□ 1,53
A430089I19RikQ8C9W1 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,62■■□□□ 1,53
A430089I19RikQ8C9W1 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,62■■□□□ 1,53
A430089I19RikQ8C9W1 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC24,62■■□□□ 1,53
A430089I19RikQ8C9W1 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC24,62■■□□□ 1,53
A430089I19RikQ8C9W1 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24,62■■□□□ 1,53
A430089I19RikQ8C9W1 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,61■■□□□ 1,53
A430089I19RikQ8C9W1 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,61■■□□□ 1,53
A430089I19RikQ8C9W1 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC24,61■■□□□ 1,53
A430089I19RikQ8C9W1 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC24,6■■□□□ 1,53
A430089I19RikQ8C9W1 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24,6■■□□□ 1,53
A430089I19RikQ8C9W1 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24,6■■□□□ 1,53
A430089I19RikQ8C9W1 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,59■■□□□ 1,53
A430089I19RikQ8C9W1 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC24,59■■□□□ 1,53
A430089I19RikQ8C9W1 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,59■■□□□ 1,53
A430089I19RikQ8C9W1 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,58■■□□□ 1,53
A430089I19RikQ8C9W1 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,58■■□□□ 1,53
A430089I19RikQ8C9W1 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC24,58■■□□□ 1,53
A430089I19RikQ8C9W1 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,58■■□□□ 1,53
A430089I19RikQ8C9W1 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,58■■□□□ 1,53
A430089I19RikQ8C9W1 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,58■■□□□ 1,52
A430089I19RikQ8C9W1 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC24,57■■□□□ 1,52
A430089I19RikQ8C9W1 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC24,57■■□□□ 1,52
A430089I19RikQ8C9W1 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC24,57■■□□□ 1,52
A430089I19RikQ8C9W1 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,57■■□□□ 1,52
A430089I19RikQ8C9W1 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24,56■■□□□ 1,52
A430089I19RikQ8C9W1 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24,56■■□□□ 1,52
A430089I19RikQ8C9W1 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24,56■■□□□ 1,52
A430089I19RikQ8C9W1 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24,55■■□□□ 1,52
A430089I19RikQ8C9W1 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,55■■□□□ 1,52
A430089I19RikQ8C9W1 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC24,54■■□□□ 1,52
A430089I19RikQ8C9W1 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24,54■■□□□ 1,52
A430089I19RikQ8C9W1 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,54■■□□□ 1,52
A430089I19RikQ8C9W1 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24,53■■□□□ 1,52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13,2 ms