Protein–RNA interactions for Protein: Q8C9S4

Ccdc186, Coiled-coil domain-containing protein 186, mousemouse

Predictions only

Length 917 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc186Q8C9S4 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ccdc186Q8C9S4 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Ccdc186Q8C9S4 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ccdc186Q8C9S4 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ccdc186Q8C9S4 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ccdc186Q8C9S4 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ccdc186Q8C9S4 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ccdc186Q8C9S4 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ccdc186Q8C9S4 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ccdc186Q8C9S4 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ccdc186Q8C9S4 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ccdc186Q8C9S4 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ccdc186Q8C9S4 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ccdc186Q8C9S4 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ccdc186Q8C9S4 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ccdc186Q8C9S4 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ccdc186Q8C9S4 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ccdc186Q8C9S4 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ccdc186Q8C9S4 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ccdc186Q8C9S4 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ccdc186Q8C9S4 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ccdc186Q8C9S4 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ccdc186Q8C9S4 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ccdc186Q8C9S4 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ccdc186Q8C9S4 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ccdc186Q8C9S4 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.43
Ccdc186Q8C9S4 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ccdc186Q8C9S4 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ccdc186Q8C9S4 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ccdc186Q8C9S4 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
Ccdc186Q8C9S4 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ccdc186Q8C9S4 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
Ccdc186Q8C9S4 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ccdc186Q8C9S4 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ccdc186Q8C9S4 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ccdc186Q8C9S4 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ccdc186Q8C9S4 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ccdc186Q8C9S4 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ccdc186Q8C9S4 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ccdc186Q8C9S4 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Ccdc186Q8C9S4 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Ccdc186Q8C9S4 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ccdc186Q8C9S4 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ccdc186Q8C9S4 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ccdc186Q8C9S4 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ccdc186Q8C9S4 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ccdc186Q8C9S4 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ccdc186Q8C9S4 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ccdc186Q8C9S4 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ccdc186Q8C9S4 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ccdc186Q8C9S4 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ccdc186Q8C9S4 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ccdc186Q8C9S4 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ccdc186Q8C9S4 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ccdc186Q8C9S4 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ccdc186Q8C9S4 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ccdc186Q8C9S4 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ccdc186Q8C9S4 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ccdc186Q8C9S4 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Ccdc186Q8C9S4 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ccdc186Q8C9S4 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ccdc186Q8C9S4 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ccdc186Q8C9S4 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ccdc186Q8C9S4 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ccdc186Q8C9S4 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ccdc186Q8C9S4 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ccdc186Q8C9S4 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ccdc186Q8C9S4 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ccdc186Q8C9S4 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ccdc186Q8C9S4 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ccdc186Q8C9S4 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ccdc186Q8C9S4 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Ccdc186Q8C9S4 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ccdc186Q8C9S4 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ccdc186Q8C9S4 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ccdc186Q8C9S4 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ccdc186Q8C9S4 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ccdc186Q8C9S4 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Ccdc186Q8C9S4 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ccdc186Q8C9S4 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ccdc186Q8C9S4 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ccdc186Q8C9S4 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ccdc186Q8C9S4 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ccdc186Q8C9S4 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ccdc186Q8C9S4 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ccdc186Q8C9S4 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ccdc186Q8C9S4 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ccdc186Q8C9S4 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ccdc186Q8C9S4 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ccdc186Q8C9S4 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ccdc186Q8C9S4 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ccdc186Q8C9S4 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ccdc186Q8C9S4 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Ccdc186Q8C9S4 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ccdc186Q8C9S4 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ccdc186Q8C9S4 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ccdc186Q8C9S4 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ccdc186Q8C9S4 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ccdc186Q8C9S4 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
Ccdc186Q8C9S4 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms