Protein–RNA interactions for Protein: Q8C8T8

Tsr2, Pre-rRNA-processing protein TSR2 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 191 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tsr2Q8C8T8 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Tsr2Q8C8T8 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Tsr2Q8C8T8 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Tsr2Q8C8T8 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Tsr2Q8C8T8 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Tsr2Q8C8T8 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Tsr2Q8C8T8 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC27.54■■■□□ 2
Tsr2Q8C8T8 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
Tsr2Q8C8T8 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC27.53■■■□□ 2
Tsr2Q8C8T8 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Tsr2Q8C8T8 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Tsr2Q8C8T8 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Tsr2Q8C8T8 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
Tsr2Q8C8T8 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
Tsr2Q8C8T8 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Tsr2Q8C8T8 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Tsr2Q8C8T8 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Tsr2Q8C8T8 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Tsr2Q8C8T8 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Tsr2Q8C8T8 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Tsr2Q8C8T8 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Tsr2Q8C8T8 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Tsr2Q8C8T8 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Tsr2Q8C8T8 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Tsr2Q8C8T8 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Tsr2Q8C8T8 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Tsr2Q8C8T8 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Tsr2Q8C8T8 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Tsr2Q8C8T8 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Tsr2Q8C8T8 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Tsr2Q8C8T8 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Tsr2Q8C8T8 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
Tsr2Q8C8T8 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Tsr2Q8C8T8 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Tsr2Q8C8T8 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Tsr2Q8C8T8 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Tsr2Q8C8T8 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Tsr2Q8C8T8 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Tsr2Q8C8T8 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Tsr2Q8C8T8 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Tsr2Q8C8T8 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Tsr2Q8C8T8 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Tsr2Q8C8T8 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Tsr2Q8C8T8 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Tsr2Q8C8T8 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Tsr2Q8C8T8 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Tsr2Q8C8T8 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Tsr2Q8C8T8 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Tsr2Q8C8T8 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Tsr2Q8C8T8 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Tsr2Q8C8T8 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Tsr2Q8C8T8 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Tsr2Q8C8T8 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Tsr2Q8C8T8 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Tsr2Q8C8T8 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Tsr2Q8C8T8 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Tsr2Q8C8T8 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Tsr2Q8C8T8 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Tsr2Q8C8T8 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Tsr2Q8C8T8 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Tsr2Q8C8T8 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Tsr2Q8C8T8 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Tsr2Q8C8T8 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Tsr2Q8C8T8 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
Tsr2Q8C8T8 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Tsr2Q8C8T8 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
Tsr2Q8C8T8 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
Tsr2Q8C8T8 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Tsr2Q8C8T8 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Tsr2Q8C8T8 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Tsr2Q8C8T8 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Tsr2Q8C8T8 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Tsr2Q8C8T8 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Tsr2Q8C8T8 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Tsr2Q8C8T8 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
Tsr2Q8C8T8 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Tsr2Q8C8T8 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
Tsr2Q8C8T8 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Tsr2Q8C8T8 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Tsr2Q8C8T8 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Tsr2Q8C8T8 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Tsr2Q8C8T8 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Tsr2Q8C8T8 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Tsr2Q8C8T8 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Tsr2Q8C8T8 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Tsr2Q8C8T8 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Tsr2Q8C8T8 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Tsr2Q8C8T8 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Tsr2Q8C8T8 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Tsr2Q8C8T8 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Tsr2Q8C8T8 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Tsr2Q8C8T8 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Tsr2Q8C8T8 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Tsr2Q8C8T8 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Tsr2Q8C8T8 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Tsr2Q8C8T8 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Tsr2Q8C8T8 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Tsr2Q8C8T8 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Tsr2Q8C8T8 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Tsr2Q8C8T8 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.7 ms