Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5X1

4931406P16Rik, RIKEN cDNA 4931406P16 gene, mousemouse

Predictions only

Length 1,059 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4931406P16RikQ8C5X1 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
4931406P16RikQ8C5X1 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
4931406P16RikQ8C5X1 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
4931406P16RikQ8C5X1 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
4931406P16RikQ8C5X1 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
4931406P16RikQ8C5X1 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
4931406P16RikQ8C5X1 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
4931406P16RikQ8C5X1 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
4931406P16RikQ8C5X1 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
4931406P16RikQ8C5X1 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
4931406P16RikQ8C5X1 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
4931406P16RikQ8C5X1 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
4931406P16RikQ8C5X1 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
4931406P16RikQ8C5X1 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
4931406P16RikQ8C5X1 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
4931406P16RikQ8C5X1 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
4931406P16RikQ8C5X1 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
4931406P16RikQ8C5X1 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
4931406P16RikQ8C5X1 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
4931406P16RikQ8C5X1 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
4931406P16RikQ8C5X1 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
4931406P16RikQ8C5X1 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
4931406P16RikQ8C5X1 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
4931406P16RikQ8C5X1 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
4931406P16RikQ8C5X1 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
4931406P16RikQ8C5X1 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
4931406P16RikQ8C5X1 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
4931406P16RikQ8C5X1 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
4931406P16RikQ8C5X1 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
4931406P16RikQ8C5X1 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
4931406P16RikQ8C5X1 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
4931406P16RikQ8C5X1 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
4931406P16RikQ8C5X1 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
4931406P16RikQ8C5X1 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
4931406P16RikQ8C5X1 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
4931406P16RikQ8C5X1 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
4931406P16RikQ8C5X1 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
4931406P16RikQ8C5X1 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
4931406P16RikQ8C5X1 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
4931406P16RikQ8C5X1 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
4931406P16RikQ8C5X1 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
4931406P16RikQ8C5X1 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
4931406P16RikQ8C5X1 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
4931406P16RikQ8C5X1 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
4931406P16RikQ8C5X1 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
4931406P16RikQ8C5X1 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
4931406P16RikQ8C5X1 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
4931406P16RikQ8C5X1 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
4931406P16RikQ8C5X1 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
4931406P16RikQ8C5X1 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
4931406P16RikQ8C5X1 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
4931406P16RikQ8C5X1 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
4931406P16RikQ8C5X1 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
4931406P16RikQ8C5X1 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
4931406P16RikQ8C5X1 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
4931406P16RikQ8C5X1 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
4931406P16RikQ8C5X1 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
4931406P16RikQ8C5X1 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
4931406P16RikQ8C5X1 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
4931406P16RikQ8C5X1 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
4931406P16RikQ8C5X1 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
4931406P16RikQ8C5X1 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
4931406P16RikQ8C5X1 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
4931406P16RikQ8C5X1 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
4931406P16RikQ8C5X1 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
4931406P16RikQ8C5X1 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
4931406P16RikQ8C5X1 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
4931406P16RikQ8C5X1 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
4931406P16RikQ8C5X1 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
4931406P16RikQ8C5X1 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
4931406P16RikQ8C5X1 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
4931406P16RikQ8C5X1 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
4931406P16RikQ8C5X1 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
4931406P16RikQ8C5X1 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
4931406P16RikQ8C5X1 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
4931406P16RikQ8C5X1 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
4931406P16RikQ8C5X1 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
4931406P16RikQ8C5X1 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
4931406P16RikQ8C5X1 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
4931406P16RikQ8C5X1 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
4931406P16RikQ8C5X1 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
4931406P16RikQ8C5X1 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
4931406P16RikQ8C5X1 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
4931406P16RikQ8C5X1 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
4931406P16RikQ8C5X1 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
4931406P16RikQ8C5X1 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
4931406P16RikQ8C5X1 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
4931406P16RikQ8C5X1 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
4931406P16RikQ8C5X1 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
4931406P16RikQ8C5X1 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
4931406P16RikQ8C5X1 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
4931406P16RikQ8C5X1 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
4931406P16RikQ8C5X1 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
4931406P16RikQ8C5X1 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
4931406P16RikQ8C5X1 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
4931406P16RikQ8C5X1 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
4931406P16RikQ8C5X1 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
4931406P16RikQ8C5X1 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
4931406P16RikQ8C5X1 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
4931406P16RikQ8C5X1 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.6 ms