Protein–RNA interactions for Protein: Q8BX22

Sall4, Sal-like protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,067 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sall4Q8BX22 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Sall4Q8BX22 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Sall4Q8BX22 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Sall4Q8BX22 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Sall4Q8BX22 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Sall4Q8BX22 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Sall4Q8BX22 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Sall4Q8BX22 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Sall4Q8BX22 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Sall4Q8BX22 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Sall4Q8BX22 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Sall4Q8BX22 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Sall4Q8BX22 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Sall4Q8BX22 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Sall4Q8BX22 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Sall4Q8BX22 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Sall4Q8BX22 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Sall4Q8BX22 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Sall4Q8BX22 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Sall4Q8BX22 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Sall4Q8BX22 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Sall4Q8BX22 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sall4Q8BX22 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sall4Q8BX22 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sall4Q8BX22 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sall4Q8BX22 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sall4Q8BX22 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Sall4Q8BX22 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Sall4Q8BX22 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Sall4Q8BX22 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sall4Q8BX22 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Sall4Q8BX22 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Sall4Q8BX22 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sall4Q8BX22 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sall4Q8BX22 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sall4Q8BX22 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sall4Q8BX22 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sall4Q8BX22 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sall4Q8BX22 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Sall4Q8BX22 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sall4Q8BX22 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sall4Q8BX22 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sall4Q8BX22 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sall4Q8BX22 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sall4Q8BX22 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Sall4Q8BX22 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sall4Q8BX22 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sall4Q8BX22 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sall4Q8BX22 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sall4Q8BX22 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sall4Q8BX22 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Sall4Q8BX22 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Sall4Q8BX22 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Sall4Q8BX22 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Sall4Q8BX22 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Sall4Q8BX22 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
Sall4Q8BX22 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Sall4Q8BX22 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Sall4Q8BX22 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Sall4Q8BX22 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Sall4Q8BX22 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Sall4Q8BX22 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sall4Q8BX22 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Sall4Q8BX22 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sall4Q8BX22 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sall4Q8BX22 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sall4Q8BX22 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Sall4Q8BX22 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Sall4Q8BX22 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Sall4Q8BX22 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Sall4Q8BX22 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sall4Q8BX22 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sall4Q8BX22 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sall4Q8BX22 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sall4Q8BX22 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sall4Q8BX22 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sall4Q8BX22 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sall4Q8BX22 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Sall4Q8BX22 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sall4Q8BX22 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sall4Q8BX22 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Sall4Q8BX22 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Sall4Q8BX22 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sall4Q8BX22 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sall4Q8BX22 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sall4Q8BX22 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sall4Q8BX22 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Sall4Q8BX22 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Sall4Q8BX22 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Sall4Q8BX22 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Sall4Q8BX22 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Sall4Q8BX22 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sall4Q8BX22 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
Sall4Q8BX22 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sall4Q8BX22 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sall4Q8BX22 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sall4Q8BX22 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sall4Q8BX22 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sall4Q8BX22 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sall4Q8BX22 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms