Protein–RNA interactions for Protein: Q8BVK9

Sp110, Sp110 nuclear body protein, mousemouse

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Length 445 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Sp110Q8BVK9 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Sp110Q8BVK9 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Sp110Q8BVK9 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Sp110Q8BVK9 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Sp110Q8BVK9 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Sp110Q8BVK9 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Sp110Q8BVK9 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Sp110Q8BVK9 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
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Sp110Q8BVK9 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Sp110Q8BVK9 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
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Sp110Q8BVK9 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Sp110Q8BVK9 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Sp110Q8BVK9 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Sp110Q8BVK9 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Sp110Q8BVK9 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
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Sp110Q8BVK9 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Sp110Q8BVK9 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
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Sp110Q8BVK9 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Sp110Q8BVK9 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
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Sp110Q8BVK9 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
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Sp110Q8BVK9 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Sp110Q8BVK9 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Sp110Q8BVK9 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Sp110Q8BVK9 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC21.3■■□□□ 1
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Sp110Q8BVK9 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Sp110Q8BVK9 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
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