Protein–RNA interactions for Protein: Q8BV16

Zfp398, Zinc finger protein 398, mousemouse

Predictions only

Length 643 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp398Q8BV16 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Zfp398Q8BV16 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Zfp398Q8BV16 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Zfp398Q8BV16 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Zfp398Q8BV16 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Zfp398Q8BV16 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Zfp398Q8BV16 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Zfp398Q8BV16 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Zfp398Q8BV16 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Zfp398Q8BV16 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Zfp398Q8BV16 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Zfp398Q8BV16 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Zfp398Q8BV16 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Zfp398Q8BV16 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Zfp398Q8BV16 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Zfp398Q8BV16 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Zfp398Q8BV16 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Zfp398Q8BV16 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Zfp398Q8BV16 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Zfp398Q8BV16 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Zfp398Q8BV16 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Zfp398Q8BV16 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Zfp398Q8BV16 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Zfp398Q8BV16 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Zfp398Q8BV16 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Zfp398Q8BV16 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Zfp398Q8BV16 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Zfp398Q8BV16 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Zfp398Q8BV16 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Zfp398Q8BV16 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Zfp398Q8BV16 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Zfp398Q8BV16 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Zfp398Q8BV16 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Zfp398Q8BV16 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Zfp398Q8BV16 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Zfp398Q8BV16 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Zfp398Q8BV16 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Zfp398Q8BV16 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Zfp398Q8BV16 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Zfp398Q8BV16 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Zfp398Q8BV16 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Zfp398Q8BV16 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Zfp398Q8BV16 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Zfp398Q8BV16 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Zfp398Q8BV16 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Zfp398Q8BV16 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Zfp398Q8BV16 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Zfp398Q8BV16 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Zfp398Q8BV16 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Zfp398Q8BV16 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Zfp398Q8BV16 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Zfp398Q8BV16 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Zfp398Q8BV16 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Zfp398Q8BV16 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Zfp398Q8BV16 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Zfp398Q8BV16 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Zfp398Q8BV16 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Zfp398Q8BV16 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Zfp398Q8BV16 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Zfp398Q8BV16 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Zfp398Q8BV16 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Zfp398Q8BV16 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Zfp398Q8BV16 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Zfp398Q8BV16 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Zfp398Q8BV16 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Zfp398Q8BV16 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Zfp398Q8BV16 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Zfp398Q8BV16 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Zfp398Q8BV16 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Zfp398Q8BV16 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Zfp398Q8BV16 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Zfp398Q8BV16 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Zfp398Q8BV16 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Zfp398Q8BV16 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Zfp398Q8BV16 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Zfp398Q8BV16 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Zfp398Q8BV16 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Zfp398Q8BV16 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Zfp398Q8BV16 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Zfp398Q8BV16 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Zfp398Q8BV16 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Zfp398Q8BV16 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Zfp398Q8BV16 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Zfp398Q8BV16 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Zfp398Q8BV16 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Zfp398Q8BV16 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Zfp398Q8BV16 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Zfp398Q8BV16 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Zfp398Q8BV16 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Zfp398Q8BV16 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Zfp398Q8BV16 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Zfp398Q8BV16 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Zfp398Q8BV16 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Zfp398Q8BV16 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Zfp398Q8BV16 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Zfp398Q8BV16 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Zfp398Q8BV16 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Zfp398Q8BV16 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Zfp398Q8BV16 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Zfp398Q8BV16 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms