Protein–RNA interactions for Protein: Q8BSS9

Ppfia2, Liprin-alpha-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,257 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppfia2Q8BSS9 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ppfia2Q8BSS9 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ppfia2Q8BSS9 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ppfia2Q8BSS9 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ppfia2Q8BSS9 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ppfia2Q8BSS9 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ppfia2Q8BSS9 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ppfia2Q8BSS9 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ppfia2Q8BSS9 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Ppfia2Q8BSS9 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ppfia2Q8BSS9 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ppfia2Q8BSS9 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ppfia2Q8BSS9 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ppfia2Q8BSS9 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ppfia2Q8BSS9 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ppfia2Q8BSS9 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ppfia2Q8BSS9 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ppfia2Q8BSS9 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ppfia2Q8BSS9 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ppfia2Q8BSS9 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ppfia2Q8BSS9 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ppfia2Q8BSS9 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ppfia2Q8BSS9 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ppfia2Q8BSS9 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ppfia2Q8BSS9 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ppfia2Q8BSS9 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ppfia2Q8BSS9 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ppfia2Q8BSS9 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Ppfia2Q8BSS9 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Ppfia2Q8BSS9 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ppfia2Q8BSS9 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ppfia2Q8BSS9 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ppfia2Q8BSS9 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ppfia2Q8BSS9 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ppfia2Q8BSS9 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ppfia2Q8BSS9 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ppfia2Q8BSS9 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ppfia2Q8BSS9 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ppfia2Q8BSS9 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ppfia2Q8BSS9 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ppfia2Q8BSS9 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ppfia2Q8BSS9 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ppfia2Q8BSS9 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ppfia2Q8BSS9 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ppfia2Q8BSS9 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ppfia2Q8BSS9 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ppfia2Q8BSS9 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ppfia2Q8BSS9 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ppfia2Q8BSS9 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ppfia2Q8BSS9 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Ppfia2Q8BSS9 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ppfia2Q8BSS9 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ppfia2Q8BSS9 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ppfia2Q8BSS9 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ppfia2Q8BSS9 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ppfia2Q8BSS9 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ppfia2Q8BSS9 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ppfia2Q8BSS9 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ppfia2Q8BSS9 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ppfia2Q8BSS9 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ppfia2Q8BSS9 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ppfia2Q8BSS9 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ppfia2Q8BSS9 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ppfia2Q8BSS9 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ppfia2Q8BSS9 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ppfia2Q8BSS9 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ppfia2Q8BSS9 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ppfia2Q8BSS9 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Ppfia2Q8BSS9 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ppfia2Q8BSS9 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ppfia2Q8BSS9 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ppfia2Q8BSS9 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ppfia2Q8BSS9 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ppfia2Q8BSS9 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ppfia2Q8BSS9 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ppfia2Q8BSS9 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ppfia2Q8BSS9 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ppfia2Q8BSS9 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ppfia2Q8BSS9 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ppfia2Q8BSS9 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ppfia2Q8BSS9 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ppfia2Q8BSS9 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ppfia2Q8BSS9 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ppfia2Q8BSS9 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ppfia2Q8BSS9 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ppfia2Q8BSS9 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ppfia2Q8BSS9 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ppfia2Q8BSS9 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ppfia2Q8BSS9 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ppfia2Q8BSS9 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ppfia2Q8BSS9 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ppfia2Q8BSS9 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ppfia2Q8BSS9 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ppfia2Q8BSS9 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Ppfia2Q8BSS9 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ppfia2Q8BSS9 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ppfia2Q8BSS9 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ppfia2Q8BSS9 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ppfia2Q8BSS9 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ppfia2Q8BSS9 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.8 ms