Protein–RNA interactions for Protein: Q8BS39

Ccdc32, Coiled-coil domain-containing protein 32, mousemouse

Predictions only

Length 179 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc32Q8BS39 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc32Q8BS39 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc32Q8BS39 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc32Q8BS39 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc32Q8BS39 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc32Q8BS39 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc32Q8BS39 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc32Q8BS39 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc32Q8BS39 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc32Q8BS39 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc32Q8BS39 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ccdc32Q8BS39 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ccdc32Q8BS39 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ccdc32Q8BS39 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ccdc32Q8BS39 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc32Q8BS39 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc32Q8BS39 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc32Q8BS39 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc32Q8BS39 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc32Q8BS39 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc32Q8BS39 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc32Q8BS39 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc32Q8BS39 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc32Q8BS39 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc32Q8BS39 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc32Q8BS39 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc32Q8BS39 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc32Q8BS39 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc32Q8BS39 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc32Q8BS39 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc32Q8BS39 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc32Q8BS39 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc32Q8BS39 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc32Q8BS39 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccdc32Q8BS39 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccdc32Q8BS39 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccdc32Q8BS39 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
Ccdc32Q8BS39 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Ccdc32Q8BS39 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Ccdc32Q8BS39 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc32Q8BS39 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc32Q8BS39 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc32Q8BS39 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc32Q8BS39 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc32Q8BS39 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc32Q8BS39 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc32Q8BS39 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc32Q8BS39 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc32Q8BS39 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc32Q8BS39 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc32Q8BS39 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc32Q8BS39 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc32Q8BS39 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc32Q8BS39 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc32Q8BS39 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc32Q8BS39 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccdc32Q8BS39 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccdc32Q8BS39 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccdc32Q8BS39 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccdc32Q8BS39 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccdc32Q8BS39 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccdc32Q8BS39 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccdc32Q8BS39 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc32Q8BS39 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc32Q8BS39 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc32Q8BS39 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc32Q8BS39 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc32Q8BS39 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc32Q8BS39 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc32Q8BS39 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc32Q8BS39 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Ccdc32Q8BS39 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccdc32Q8BS39 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccdc32Q8BS39 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccdc32Q8BS39 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc32Q8BS39 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc32Q8BS39 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc32Q8BS39 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc32Q8BS39 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccdc32Q8BS39 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccdc32Q8BS39 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccdc32Q8BS39 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccdc32Q8BS39 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccdc32Q8BS39 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccdc32Q8BS39 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccdc32Q8BS39 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc32Q8BS39 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc32Q8BS39 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc32Q8BS39 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc32Q8BS39 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc32Q8BS39 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc32Q8BS39 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc32Q8BS39 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc32Q8BS39 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccdc32Q8BS39 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccdc32Q8BS39 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccdc32Q8BS39 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccdc32Q8BS39 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccdc32Q8BS39 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccdc32Q8BS39 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.5 ms