Protein–RNA interactions for Protein: Q8BPS4

Gpr180, Integral membrane protein GPR180, mousemouse

Predictions only

Length 441 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpr180Q8BPS4 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Gpr180Q8BPS4 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Gpr180Q8BPS4 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Gpr180Q8BPS4 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Gpr180Q8BPS4 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Gpr180Q8BPS4 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Gpr180Q8BPS4 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Gpr180Q8BPS4 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Gpr180Q8BPS4 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Gpr180Q8BPS4 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Gpr180Q8BPS4 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Gpr180Q8BPS4 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
Gpr180Q8BPS4 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
Gpr180Q8BPS4 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Gpr180Q8BPS4 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Gpr180Q8BPS4 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Gpr180Q8BPS4 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Gpr180Q8BPS4 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Gpr180Q8BPS4 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Gpr180Q8BPS4 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Gpr180Q8BPS4 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Gpr180Q8BPS4 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Gpr180Q8BPS4 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Gpr180Q8BPS4 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Gpr180Q8BPS4 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
Gpr180Q8BPS4 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Gpr180Q8BPS4 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Gpr180Q8BPS4 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Gpr180Q8BPS4 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Gpr180Q8BPS4 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
Gpr180Q8BPS4 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Gpr180Q8BPS4 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Gpr180Q8BPS4 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Gpr180Q8BPS4 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
Gpr180Q8BPS4 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Gpr180Q8BPS4 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Gpr180Q8BPS4 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Gpr180Q8BPS4 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Gpr180Q8BPS4 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Gpr180Q8BPS4 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Gpr180Q8BPS4 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Gpr180Q8BPS4 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Gpr180Q8BPS4 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Gpr180Q8BPS4 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Gpr180Q8BPS4 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
Gpr180Q8BPS4 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
Gpr180Q8BPS4 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Gpr180Q8BPS4 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Gpr180Q8BPS4 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Gpr180Q8BPS4 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Gpr180Q8BPS4 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Gpr180Q8BPS4 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Gpr180Q8BPS4 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Gpr180Q8BPS4 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Gpr180Q8BPS4 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Gpr180Q8BPS4 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Gpr180Q8BPS4 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Gpr180Q8BPS4 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Gpr180Q8BPS4 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Gpr180Q8BPS4 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Gpr180Q8BPS4 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Gpr180Q8BPS4 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
Gpr180Q8BPS4 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Gpr180Q8BPS4 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Gpr180Q8BPS4 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Gpr180Q8BPS4 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Gpr180Q8BPS4 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Gpr180Q8BPS4 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Gpr180Q8BPS4 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Gpr180Q8BPS4 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Gpr180Q8BPS4 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Gpr180Q8BPS4 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Gpr180Q8BPS4 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Gpr180Q8BPS4 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Gpr180Q8BPS4 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Gpr180Q8BPS4 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Gpr180Q8BPS4 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Gpr180Q8BPS4 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Gpr180Q8BPS4 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Gpr180Q8BPS4 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Gpr180Q8BPS4 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Gpr180Q8BPS4 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Gpr180Q8BPS4 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Gpr180Q8BPS4 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Gpr180Q8BPS4 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Gpr180Q8BPS4 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Gpr180Q8BPS4 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Gpr180Q8BPS4 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Gpr180Q8BPS4 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Gpr180Q8BPS4 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Gpr180Q8BPS4 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Gpr180Q8BPS4 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Gpr180Q8BPS4 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Gpr180Q8BPS4 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Gpr180Q8BPS4 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Gpr180Q8BPS4 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Gpr180Q8BPS4 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Gpr180Q8BPS4 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Gpr180Q8BPS4 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Gpr180Q8BPS4 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 124.5 ms