Protein–RNA interactions for Protein: Q8BK84

Dupd1, Dual specificity phosphatase DUPD1, mousemouse

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dupd1Q8BK84 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Dupd1Q8BK84 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Dupd1Q8BK84 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Dupd1Q8BK84 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Dupd1Q8BK84 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Dupd1Q8BK84 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Dupd1Q8BK84 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Dupd1Q8BK84 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Dupd1Q8BK84 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Dupd1Q8BK84 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Dupd1Q8BK84 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Dupd1Q8BK84 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Dupd1Q8BK84 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Dupd1Q8BK84 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Dupd1Q8BK84 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Dupd1Q8BK84 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Dupd1Q8BK84 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Dupd1Q8BK84 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Dupd1Q8BK84 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Dupd1Q8BK84 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Dupd1Q8BK84 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Dupd1Q8BK84 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Dupd1Q8BK84 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Dupd1Q8BK84 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Dupd1Q8BK84 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Dupd1Q8BK84 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Dupd1Q8BK84 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Dupd1Q8BK84 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Dupd1Q8BK84 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Dupd1Q8BK84 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Dupd1Q8BK84 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Dupd1Q8BK84 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Dupd1Q8BK84 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Dupd1Q8BK84 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Dupd1Q8BK84 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Dupd1Q8BK84 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Dupd1Q8BK84 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Dupd1Q8BK84 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Dupd1Q8BK84 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Dupd1Q8BK84 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Dupd1Q8BK84 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Dupd1Q8BK84 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Dupd1Q8BK84 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Dupd1Q8BK84 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Dupd1Q8BK84 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Dupd1Q8BK84 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Dupd1Q8BK84 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Dupd1Q8BK84 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Dupd1Q8BK84 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Dupd1Q8BK84 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Dupd1Q8BK84 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Dupd1Q8BK84 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Dupd1Q8BK84 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Dupd1Q8BK84 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Dupd1Q8BK84 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Dupd1Q8BK84 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Dupd1Q8BK84 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Dupd1Q8BK84 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Dupd1Q8BK84 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Dupd1Q8BK84 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Dupd1Q8BK84 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Dupd1Q8BK84 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Dupd1Q8BK84 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Dupd1Q8BK84 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Dupd1Q8BK84 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Dupd1Q8BK84 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Dupd1Q8BK84 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Dupd1Q8BK84 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Dupd1Q8BK84 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Dupd1Q8BK84 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Dupd1Q8BK84 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Dupd1Q8BK84 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Dupd1Q8BK84 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Dupd1Q8BK84 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Dupd1Q8BK84 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Dupd1Q8BK84 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Dupd1Q8BK84 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Dupd1Q8BK84 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Dupd1Q8BK84 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Dupd1Q8BK84 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Dupd1Q8BK84 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Dupd1Q8BK84 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Dupd1Q8BK84 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Dupd1Q8BK84 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Dupd1Q8BK84 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Dupd1Q8BK84 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Dupd1Q8BK84 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Dupd1Q8BK84 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Dupd1Q8BK84 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Dupd1Q8BK84 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Dupd1Q8BK84 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Dupd1Q8BK84 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Dupd1Q8BK84 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Dupd1Q8BK84 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Dupd1Q8BK84 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Dupd1Q8BK84 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Dupd1Q8BK84 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Dupd1Q8BK84 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Dupd1Q8BK84 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Dupd1Q8BK84 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.2 ms