Protein–RNA interactions for Protein: Q8BJX2

6820408C15Rik, RIKEN cDNA 6820408C15, mousemouse

Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
6820408C15RikQ8BJX2 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
6820408C15RikQ8BJX2 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
6820408C15RikQ8BJX2 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
6820408C15RikQ8BJX2 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
6820408C15RikQ8BJX2 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
6820408C15RikQ8BJX2 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
6820408C15RikQ8BJX2 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
6820408C15RikQ8BJX2 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
6820408C15RikQ8BJX2 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
6820408C15RikQ8BJX2 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.72■■□□□ 1.71
6820408C15RikQ8BJX2 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
6820408C15RikQ8BJX2 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
6820408C15RikQ8BJX2 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
6820408C15RikQ8BJX2 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
6820408C15RikQ8BJX2 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
6820408C15RikQ8BJX2 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
6820408C15RikQ8BJX2 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
6820408C15RikQ8BJX2 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
6820408C15RikQ8BJX2 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
6820408C15RikQ8BJX2 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
6820408C15RikQ8BJX2 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
6820408C15RikQ8BJX2 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
6820408C15RikQ8BJX2 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
6820408C15RikQ8BJX2 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
6820408C15RikQ8BJX2 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
6820408C15RikQ8BJX2 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
6820408C15RikQ8BJX2 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
6820408C15RikQ8BJX2 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
6820408C15RikQ8BJX2 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
6820408C15RikQ8BJX2 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
6820408C15RikQ8BJX2 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
6820408C15RikQ8BJX2 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
6820408C15RikQ8BJX2 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
6820408C15RikQ8BJX2 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
6820408C15RikQ8BJX2 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
6820408C15RikQ8BJX2 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
6820408C15RikQ8BJX2 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
6820408C15RikQ8BJX2 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
6820408C15RikQ8BJX2 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
6820408C15RikQ8BJX2 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
6820408C15RikQ8BJX2 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
6820408C15RikQ8BJX2 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
6820408C15RikQ8BJX2 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
6820408C15RikQ8BJX2 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
6820408C15RikQ8BJX2 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
6820408C15RikQ8BJX2 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
6820408C15RikQ8BJX2 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
6820408C15RikQ8BJX2 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
6820408C15RikQ8BJX2 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
6820408C15RikQ8BJX2 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
6820408C15RikQ8BJX2 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
6820408C15RikQ8BJX2 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
6820408C15RikQ8BJX2 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
6820408C15RikQ8BJX2 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
6820408C15RikQ8BJX2 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
6820408C15RikQ8BJX2 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
6820408C15RikQ8BJX2 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
6820408C15RikQ8BJX2 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
6820408C15RikQ8BJX2 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
6820408C15RikQ8BJX2 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
6820408C15RikQ8BJX2 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
6820408C15RikQ8BJX2 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
6820408C15RikQ8BJX2 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
6820408C15RikQ8BJX2 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
6820408C15RikQ8BJX2 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
6820408C15RikQ8BJX2 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
6820408C15RikQ8BJX2 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
6820408C15RikQ8BJX2 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
6820408C15RikQ8BJX2 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
6820408C15RikQ8BJX2 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
6820408C15RikQ8BJX2 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
6820408C15RikQ8BJX2 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
6820408C15RikQ8BJX2 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
6820408C15RikQ8BJX2 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
6820408C15RikQ8BJX2 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
6820408C15RikQ8BJX2 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
6820408C15RikQ8BJX2 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
6820408C15RikQ8BJX2 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
6820408C15RikQ8BJX2 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
6820408C15RikQ8BJX2 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
6820408C15RikQ8BJX2 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
6820408C15RikQ8BJX2 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
6820408C15RikQ8BJX2 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
6820408C15RikQ8BJX2 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
6820408C15RikQ8BJX2 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
6820408C15RikQ8BJX2 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
6820408C15RikQ8BJX2 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
6820408C15RikQ8BJX2 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
6820408C15RikQ8BJX2 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
6820408C15RikQ8BJX2 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
6820408C15RikQ8BJX2 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
6820408C15RikQ8BJX2 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
6820408C15RikQ8BJX2 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
6820408C15RikQ8BJX2 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
6820408C15RikQ8BJX2 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
6820408C15RikQ8BJX2 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
6820408C15RikQ8BJX2 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
6820408C15RikQ8BJX2 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
6820408C15RikQ8BJX2 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
6820408C15RikQ8BJX2 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms