Protein–RNA interactions for Protein: Q8BJQ9

Csgalnact1, Chondroitin sulfate N-acetylgalactosaminyltransferase 1, mousemouse

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csgalnact1Q8BJQ9 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Csgalnact1Q8BJQ9 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Csgalnact1Q8BJQ9 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Csgalnact1Q8BJQ9 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Csgalnact1Q8BJQ9 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Csgalnact1Q8BJQ9 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Csgalnact1Q8BJQ9 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Csgalnact1Q8BJQ9 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Csgalnact1Q8BJQ9 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Csgalnact1Q8BJQ9 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Csgalnact1Q8BJQ9 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Csgalnact1Q8BJQ9 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Csgalnact1Q8BJQ9 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Csgalnact1Q8BJQ9 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Csgalnact1Q8BJQ9 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Csgalnact1Q8BJQ9 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Csgalnact1Q8BJQ9 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Csgalnact1Q8BJQ9 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Csgalnact1Q8BJQ9 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Csgalnact1Q8BJQ9 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Csgalnact1Q8BJQ9 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Csgalnact1Q8BJQ9 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Csgalnact1Q8BJQ9 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Csgalnact1Q8BJQ9 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Csgalnact1Q8BJQ9 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Csgalnact1Q8BJQ9 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Csgalnact1Q8BJQ9 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Csgalnact1Q8BJQ9 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Csgalnact1Q8BJQ9 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Csgalnact1Q8BJQ9 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Csgalnact1Q8BJQ9 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Csgalnact1Q8BJQ9 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Csgalnact1Q8BJQ9 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Csgalnact1Q8BJQ9 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Csgalnact1Q8BJQ9 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Csgalnact1Q8BJQ9 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Csgalnact1Q8BJQ9 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Csgalnact1Q8BJQ9 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Csgalnact1Q8BJQ9 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Csgalnact1Q8BJQ9 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Csgalnact1Q8BJQ9 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Csgalnact1Q8BJQ9 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Csgalnact1Q8BJQ9 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Csgalnact1Q8BJQ9 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Csgalnact1Q8BJQ9 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Csgalnact1Q8BJQ9 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Csgalnact1Q8BJQ9 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Csgalnact1Q8BJQ9 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Csgalnact1Q8BJQ9 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Csgalnact1Q8BJQ9 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Csgalnact1Q8BJQ9 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Csgalnact1Q8BJQ9 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Csgalnact1Q8BJQ9 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Csgalnact1Q8BJQ9 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Csgalnact1Q8BJQ9 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Csgalnact1Q8BJQ9 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Csgalnact1Q8BJQ9 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Csgalnact1Q8BJQ9 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Csgalnact1Q8BJQ9 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Csgalnact1Q8BJQ9 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Csgalnact1Q8BJQ9 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Csgalnact1Q8BJQ9 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Csgalnact1Q8BJQ9 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Csgalnact1Q8BJQ9 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Csgalnact1Q8BJQ9 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Csgalnact1Q8BJQ9 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Csgalnact1Q8BJQ9 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Csgalnact1Q8BJQ9 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Csgalnact1Q8BJQ9 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Csgalnact1Q8BJQ9 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Csgalnact1Q8BJQ9 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Csgalnact1Q8BJQ9 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Csgalnact1Q8BJQ9 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Csgalnact1Q8BJQ9 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Csgalnact1Q8BJQ9 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Csgalnact1Q8BJQ9 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Csgalnact1Q8BJQ9 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Csgalnact1Q8BJQ9 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Csgalnact1Q8BJQ9 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Csgalnact1Q8BJQ9 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Csgalnact1Q8BJQ9 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Csgalnact1Q8BJQ9 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Csgalnact1Q8BJQ9 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Csgalnact1Q8BJQ9 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Csgalnact1Q8BJQ9 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Csgalnact1Q8BJQ9 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Csgalnact1Q8BJQ9 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Csgalnact1Q8BJQ9 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Csgalnact1Q8BJQ9 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Csgalnact1Q8BJQ9 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Csgalnact1Q8BJQ9 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Csgalnact1Q8BJQ9 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Csgalnact1Q8BJQ9 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Csgalnact1Q8BJQ9 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Csgalnact1Q8BJQ9 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Csgalnact1Q8BJQ9 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Csgalnact1Q8BJQ9 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Csgalnact1Q8BJQ9 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Csgalnact1Q8BJQ9 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Csgalnact1Q8BJQ9 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.9 ms