Protein–RNA interactions for Protein: Q8BJQ2

Usp1, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 1, mousemouse

Predictions only

Length 784 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp1Q8BJQ2 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Usp1Q8BJQ2 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Usp1Q8BJQ2 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Usp1Q8BJQ2 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Usp1Q8BJQ2 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Usp1Q8BJQ2 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Usp1Q8BJQ2 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Usp1Q8BJQ2 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Usp1Q8BJQ2 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Usp1Q8BJQ2 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Usp1Q8BJQ2 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Usp1Q8BJQ2 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Usp1Q8BJQ2 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Usp1Q8BJQ2 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Usp1Q8BJQ2 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Usp1Q8BJQ2 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Usp1Q8BJQ2 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Usp1Q8BJQ2 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Usp1Q8BJQ2 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Usp1Q8BJQ2 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Usp1Q8BJQ2 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Usp1Q8BJQ2 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Usp1Q8BJQ2 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Usp1Q8BJQ2 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Usp1Q8BJQ2 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Usp1Q8BJQ2 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Usp1Q8BJQ2 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Usp1Q8BJQ2 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Usp1Q8BJQ2 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Usp1Q8BJQ2 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Usp1Q8BJQ2 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
Usp1Q8BJQ2 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Usp1Q8BJQ2 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
Usp1Q8BJQ2 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Usp1Q8BJQ2 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Usp1Q8BJQ2 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
Usp1Q8BJQ2 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Usp1Q8BJQ2 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Usp1Q8BJQ2 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
Usp1Q8BJQ2 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Usp1Q8BJQ2 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Usp1Q8BJQ2 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Usp1Q8BJQ2 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Usp1Q8BJQ2 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Usp1Q8BJQ2 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Usp1Q8BJQ2 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Usp1Q8BJQ2 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Usp1Q8BJQ2 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Usp1Q8BJQ2 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Usp1Q8BJQ2 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.59
Usp1Q8BJQ2 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Usp1Q8BJQ2 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Usp1Q8BJQ2 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Usp1Q8BJQ2 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Usp1Q8BJQ2 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Usp1Q8BJQ2 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Usp1Q8BJQ2 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Usp1Q8BJQ2 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Usp1Q8BJQ2 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Usp1Q8BJQ2 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Usp1Q8BJQ2 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Usp1Q8BJQ2 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Usp1Q8BJQ2 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Usp1Q8BJQ2 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Usp1Q8BJQ2 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Usp1Q8BJQ2 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Usp1Q8BJQ2 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Usp1Q8BJQ2 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Usp1Q8BJQ2 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
Usp1Q8BJQ2 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
Usp1Q8BJQ2 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Usp1Q8BJQ2 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Usp1Q8BJQ2 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
Usp1Q8BJQ2 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
Usp1Q8BJQ2 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Usp1Q8BJQ2 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
Usp1Q8BJQ2 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Usp1Q8BJQ2 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Usp1Q8BJQ2 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Usp1Q8BJQ2 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Usp1Q8BJQ2 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Usp1Q8BJQ2 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Usp1Q8BJQ2 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Usp1Q8BJQ2 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Usp1Q8BJQ2 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Usp1Q8BJQ2 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Usp1Q8BJQ2 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Usp1Q8BJQ2 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
Usp1Q8BJQ2 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Usp1Q8BJQ2 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Usp1Q8BJQ2 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Usp1Q8BJQ2 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Usp1Q8BJQ2 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Usp1Q8BJQ2 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Usp1Q8BJQ2 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Usp1Q8BJQ2 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Usp1Q8BJQ2 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Usp1Q8BJQ2 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Usp1Q8BJQ2 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Usp1Q8BJQ2 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 103.8 ms