Protein–RNA interactions for Protein: Q8BJD1

Itih5, Inter-alpha-trypsin inhibitor heavy chain H5, mousemouse

Predictions only

Length 952 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itih5Q8BJD1 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Itih5Q8BJD1 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Itih5Q8BJD1 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Itih5Q8BJD1 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Itih5Q8BJD1 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Itih5Q8BJD1 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Itih5Q8BJD1 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Itih5Q8BJD1 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Itih5Q8BJD1 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Itih5Q8BJD1 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Itih5Q8BJD1 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Itih5Q8BJD1 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Itih5Q8BJD1 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Itih5Q8BJD1 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Itih5Q8BJD1 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Itih5Q8BJD1 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Itih5Q8BJD1 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Itih5Q8BJD1 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Itih5Q8BJD1 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Itih5Q8BJD1 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Itih5Q8BJD1 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Itih5Q8BJD1 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Itih5Q8BJD1 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Itih5Q8BJD1 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Itih5Q8BJD1 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Itih5Q8BJD1 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Itih5Q8BJD1 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Itih5Q8BJD1 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Itih5Q8BJD1 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Itih5Q8BJD1 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Itih5Q8BJD1 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Itih5Q8BJD1 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Itih5Q8BJD1 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Itih5Q8BJD1 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Itih5Q8BJD1 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Itih5Q8BJD1 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Itih5Q8BJD1 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Itih5Q8BJD1 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Itih5Q8BJD1 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Itih5Q8BJD1 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Itih5Q8BJD1 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Itih5Q8BJD1 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Itih5Q8BJD1 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Itih5Q8BJD1 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Itih5Q8BJD1 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Itih5Q8BJD1 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Itih5Q8BJD1 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Itih5Q8BJD1 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Itih5Q8BJD1 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Itih5Q8BJD1 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Itih5Q8BJD1 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Itih5Q8BJD1 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Itih5Q8BJD1 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Itih5Q8BJD1 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Itih5Q8BJD1 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Itih5Q8BJD1 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Itih5Q8BJD1 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Itih5Q8BJD1 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Itih5Q8BJD1 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Itih5Q8BJD1 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Itih5Q8BJD1 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Itih5Q8BJD1 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Itih5Q8BJD1 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Itih5Q8BJD1 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Itih5Q8BJD1 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Itih5Q8BJD1 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Itih5Q8BJD1 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Itih5Q8BJD1 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Itih5Q8BJD1 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Itih5Q8BJD1 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Itih5Q8BJD1 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Itih5Q8BJD1 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Itih5Q8BJD1 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Itih5Q8BJD1 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Itih5Q8BJD1 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Itih5Q8BJD1 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Itih5Q8BJD1 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Itih5Q8BJD1 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Itih5Q8BJD1 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Itih5Q8BJD1 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Itih5Q8BJD1 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Itih5Q8BJD1 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Itih5Q8BJD1 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Itih5Q8BJD1 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Itih5Q8BJD1 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Itih5Q8BJD1 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Itih5Q8BJD1 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Itih5Q8BJD1 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Itih5Q8BJD1 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Itih5Q8BJD1 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Itih5Q8BJD1 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Itih5Q8BJD1 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Itih5Q8BJD1 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Itih5Q8BJD1 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Itih5Q8BJD1 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Itih5Q8BJD1 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Itih5Q8BJD1 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Itih5Q8BJD1 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Itih5Q8BJD1 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Itih5Q8BJD1 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.1 ms