Protein–RNA interactions for Protein: Q8BHW4

4933430I17Rik, RIKEN cDNA 4933430I17 gene, mousemouse

Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4933430I17RikQ8BHW4 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
4933430I17RikQ8BHW4 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
4933430I17RikQ8BHW4 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
4933430I17RikQ8BHW4 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
4933430I17RikQ8BHW4 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
4933430I17RikQ8BHW4 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
4933430I17RikQ8BHW4 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
4933430I17RikQ8BHW4 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
4933430I17RikQ8BHW4 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
4933430I17RikQ8BHW4 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
4933430I17RikQ8BHW4 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
4933430I17RikQ8BHW4 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
4933430I17RikQ8BHW4 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
4933430I17RikQ8BHW4 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
4933430I17RikQ8BHW4 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
4933430I17RikQ8BHW4 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
4933430I17RikQ8BHW4 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
4933430I17RikQ8BHW4 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
4933430I17RikQ8BHW4 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
4933430I17RikQ8BHW4 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
4933430I17RikQ8BHW4 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
4933430I17RikQ8BHW4 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
4933430I17RikQ8BHW4 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
4933430I17RikQ8BHW4 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
4933430I17RikQ8BHW4 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
4933430I17RikQ8BHW4 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
4933430I17RikQ8BHW4 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
4933430I17RikQ8BHW4 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
4933430I17RikQ8BHW4 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
4933430I17RikQ8BHW4 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
4933430I17RikQ8BHW4 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
4933430I17RikQ8BHW4 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
4933430I17RikQ8BHW4 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
4933430I17RikQ8BHW4 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
4933430I17RikQ8BHW4 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
4933430I17RikQ8BHW4 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
4933430I17RikQ8BHW4 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
4933430I17RikQ8BHW4 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
4933430I17RikQ8BHW4 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
4933430I17RikQ8BHW4 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
4933430I17RikQ8BHW4 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
4933430I17RikQ8BHW4 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
4933430I17RikQ8BHW4 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
4933430I17RikQ8BHW4 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
4933430I17RikQ8BHW4 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
4933430I17RikQ8BHW4 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
4933430I17RikQ8BHW4 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
4933430I17RikQ8BHW4 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
4933430I17RikQ8BHW4 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
4933430I17RikQ8BHW4 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
4933430I17RikQ8BHW4 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
4933430I17RikQ8BHW4 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
4933430I17RikQ8BHW4 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
4933430I17RikQ8BHW4 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
4933430I17RikQ8BHW4 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
4933430I17RikQ8BHW4 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
4933430I17RikQ8BHW4 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
4933430I17RikQ8BHW4 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
4933430I17RikQ8BHW4 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
4933430I17RikQ8BHW4 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
4933430I17RikQ8BHW4 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
4933430I17RikQ8BHW4 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
4933430I17RikQ8BHW4 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
4933430I17RikQ8BHW4 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
4933430I17RikQ8BHW4 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
4933430I17RikQ8BHW4 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
4933430I17RikQ8BHW4 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
4933430I17RikQ8BHW4 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
4933430I17RikQ8BHW4 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
4933430I17RikQ8BHW4 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
4933430I17RikQ8BHW4 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
4933430I17RikQ8BHW4 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
4933430I17RikQ8BHW4 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
4933430I17RikQ8BHW4 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
4933430I17RikQ8BHW4 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
4933430I17RikQ8BHW4 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
4933430I17RikQ8BHW4 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
4933430I17RikQ8BHW4 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
4933430I17RikQ8BHW4 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
4933430I17RikQ8BHW4 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
4933430I17RikQ8BHW4 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
4933430I17RikQ8BHW4 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
4933430I17RikQ8BHW4 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
4933430I17RikQ8BHW4 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
4933430I17RikQ8BHW4 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
4933430I17RikQ8BHW4 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
4933430I17RikQ8BHW4 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
4933430I17RikQ8BHW4 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
4933430I17RikQ8BHW4 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
4933430I17RikQ8BHW4 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
4933430I17RikQ8BHW4 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
4933430I17RikQ8BHW4 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
4933430I17RikQ8BHW4 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
4933430I17RikQ8BHW4 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
4933430I17RikQ8BHW4 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
4933430I17RikQ8BHW4 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
4933430I17RikQ8BHW4 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
4933430I17RikQ8BHW4 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
4933430I17RikQ8BHW4 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
4933430I17RikQ8BHW4 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms