Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGQ1

Vipas39, Spermatogenesis-defective protein 39 homolog, mousemouse

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Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vipas39Q8BGQ1 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Vipas39Q8BGQ1 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Vipas39Q8BGQ1 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Vipas39Q8BGQ1 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Vipas39Q8BGQ1 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Vipas39Q8BGQ1 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Vipas39Q8BGQ1 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Vipas39Q8BGQ1 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Vipas39Q8BGQ1 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Vipas39Q8BGQ1 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Vipas39Q8BGQ1 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Vipas39Q8BGQ1 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Vipas39Q8BGQ1 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Vipas39Q8BGQ1 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Vipas39Q8BGQ1 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Vipas39Q8BGQ1 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Vipas39Q8BGQ1 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Vipas39Q8BGQ1 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Vipas39Q8BGQ1 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Vipas39Q8BGQ1 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Vipas39Q8BGQ1 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Vipas39Q8BGQ1 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Vipas39Q8BGQ1 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Vipas39Q8BGQ1 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Vipas39Q8BGQ1 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Vipas39Q8BGQ1 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Vipas39Q8BGQ1 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Vipas39Q8BGQ1 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Vipas39Q8BGQ1 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Vipas39Q8BGQ1 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Vipas39Q8BGQ1 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Vipas39Q8BGQ1 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Vipas39Q8BGQ1 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Vipas39Q8BGQ1 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Vipas39Q8BGQ1 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Vipas39Q8BGQ1 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Vipas39Q8BGQ1 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Vipas39Q8BGQ1 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Vipas39Q8BGQ1 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Vipas39Q8BGQ1 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Vipas39Q8BGQ1 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Vipas39Q8BGQ1 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Vipas39Q8BGQ1 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Vipas39Q8BGQ1 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Vipas39Q8BGQ1 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Vipas39Q8BGQ1 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Vipas39Q8BGQ1 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Vipas39Q8BGQ1 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Vipas39Q8BGQ1 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Vipas39Q8BGQ1 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Vipas39Q8BGQ1 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Vipas39Q8BGQ1 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Vipas39Q8BGQ1 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Vipas39Q8BGQ1 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Vipas39Q8BGQ1 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Vipas39Q8BGQ1 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Vipas39Q8BGQ1 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Vipas39Q8BGQ1 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Vipas39Q8BGQ1 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Vipas39Q8BGQ1 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Vipas39Q8BGQ1 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Vipas39Q8BGQ1 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Vipas39Q8BGQ1 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Vipas39Q8BGQ1 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Vipas39Q8BGQ1 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Vipas39Q8BGQ1 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Vipas39Q8BGQ1 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Vipas39Q8BGQ1 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Vipas39Q8BGQ1 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Vipas39Q8BGQ1 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Vipas39Q8BGQ1 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Vipas39Q8BGQ1 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Vipas39Q8BGQ1 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Vipas39Q8BGQ1 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Vipas39Q8BGQ1 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Vipas39Q8BGQ1 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Vipas39Q8BGQ1 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Vipas39Q8BGQ1 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Vipas39Q8BGQ1 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Vipas39Q8BGQ1 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Vipas39Q8BGQ1 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Vipas39Q8BGQ1 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Vipas39Q8BGQ1 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Vipas39Q8BGQ1 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Vipas39Q8BGQ1 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Vipas39Q8BGQ1 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Vipas39Q8BGQ1 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Vipas39Q8BGQ1 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Vipas39Q8BGQ1 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Vipas39Q8BGQ1 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Vipas39Q8BGQ1 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Vipas39Q8BGQ1 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Vipas39Q8BGQ1 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Vipas39Q8BGQ1 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Vipas39Q8BGQ1 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Vipas39Q8BGQ1 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Vipas39Q8BGQ1 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Vipas39Q8BGQ1 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Vipas39Q8BGQ1 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Vipas39Q8BGQ1 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
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