Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGN9

Uncharacterized protein C1orf115 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8BGN9 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Q8BGN9 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Q8BGN9 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Q8BGN9 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Q8BGN9 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Q8BGN9 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Q8BGN9 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Q8BGN9 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Q8BGN9 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Q8BGN9 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Q8BGN9 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Q8BGN9 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Q8BGN9 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Q8BGN9 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Q8BGN9 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Q8BGN9 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Q8BGN9 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Q8BGN9 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Q8BGN9 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
Q8BGN9 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Q8BGN9 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Q8BGN9 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Q8BGN9 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Q8BGN9 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Q8BGN9 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Q8BGN9 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Q8BGN9 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Q8BGN9 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Q8BGN9 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Q8BGN9 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Q8BGN9 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Q8BGN9 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Q8BGN9 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Q8BGN9 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Q8BGN9 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Q8BGN9 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Q8BGN9 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Q8BGN9 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Q8BGN9 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Q8BGN9 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Q8BGN9 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Q8BGN9 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Q8BGN9 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Q8BGN9 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Q8BGN9 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Q8BGN9 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Q8BGN9 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Q8BGN9 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Q8BGN9 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Q8BGN9 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Q8BGN9 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
Q8BGN9 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Q8BGN9 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Q8BGN9 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
Q8BGN9 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Q8BGN9 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Q8BGN9 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Q8BGN9 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Q8BGN9 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Q8BGN9 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Q8BGN9 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Q8BGN9 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Q8BGN9 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Q8BGN9 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Q8BGN9 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Q8BGN9 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Q8BGN9 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Q8BGN9 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Q8BGN9 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Q8BGN9 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Q8BGN9 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Q8BGN9 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Q8BGN9 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Q8BGN9 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC25.39■■□□□ 1.65
Q8BGN9 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC25.39■■□□□ 1.65
Q8BGN9 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Q8BGN9 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Q8BGN9 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Q8BGN9 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Q8BGN9 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Q8BGN9 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Q8BGN9 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Q8BGN9 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Q8BGN9 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Q8BGN9 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Q8BGN9 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Q8BGN9 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Q8BGN9 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Q8BGN9 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Q8BGN9 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Q8BGN9 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Q8BGN9 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Q8BGN9 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Q8BGN9 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Q8BGN9 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Q8BGN9 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Q8BGN9 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Q8BGN9 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Q8BGN9 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Q8BGN9 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.4 ms