Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGJ9

U2af1l4, Splicing factor U2AF 26 kDa subunit, mousemouse

Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U2af1l4Q8BGJ9 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
U2af1l4Q8BGJ9 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
U2af1l4Q8BGJ9 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC27.77■■■□□ 2.04
U2af1l4Q8BGJ9 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC27.77■■■□□ 2.04
U2af1l4Q8BGJ9 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
U2af1l4Q8BGJ9 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
U2af1l4Q8BGJ9 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
U2af1l4Q8BGJ9 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
U2af1l4Q8BGJ9 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
U2af1l4Q8BGJ9 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
U2af1l4Q8BGJ9 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
U2af1l4Q8BGJ9 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
U2af1l4Q8BGJ9 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
U2af1l4Q8BGJ9 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
U2af1l4Q8BGJ9 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.71■■■□□ 2.03
U2af1l4Q8BGJ9 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
U2af1l4Q8BGJ9 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
U2af1l4Q8BGJ9 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
U2af1l4Q8BGJ9 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
U2af1l4Q8BGJ9 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
U2af1l4Q8BGJ9 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
U2af1l4Q8BGJ9 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
U2af1l4Q8BGJ9 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
U2af1l4Q8BGJ9 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
U2af1l4Q8BGJ9 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
U2af1l4Q8BGJ9 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
U2af1l4Q8BGJ9 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
U2af1l4Q8BGJ9 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
U2af1l4Q8BGJ9 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
U2af1l4Q8BGJ9 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
U2af1l4Q8BGJ9 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
U2af1l4Q8BGJ9 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
U2af1l4Q8BGJ9 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
U2af1l4Q8BGJ9 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
U2af1l4Q8BGJ9 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
U2af1l4Q8BGJ9 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
U2af1l4Q8BGJ9 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
U2af1l4Q8BGJ9 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
U2af1l4Q8BGJ9 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC27.63■■■□□ 2.01
U2af1l4Q8BGJ9 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
U2af1l4Q8BGJ9 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
U2af1l4Q8BGJ9 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
U2af1l4Q8BGJ9 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
U2af1l4Q8BGJ9 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
U2af1l4Q8BGJ9 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
U2af1l4Q8BGJ9 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
U2af1l4Q8BGJ9 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
U2af1l4Q8BGJ9 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
U2af1l4Q8BGJ9 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
U2af1l4Q8BGJ9 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
U2af1l4Q8BGJ9 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC27.58■■■□□ 2.01
U2af1l4Q8BGJ9 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
U2af1l4Q8BGJ9 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC27.57■■■□□ 2
U2af1l4Q8BGJ9 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC27.57■■■□□ 2
U2af1l4Q8BGJ9 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
U2af1l4Q8BGJ9 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
U2af1l4Q8BGJ9 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
U2af1l4Q8BGJ9 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
U2af1l4Q8BGJ9 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
U2af1l4Q8BGJ9 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
U2af1l4Q8BGJ9 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
U2af1l4Q8BGJ9 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
U2af1l4Q8BGJ9 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
U2af1l4Q8BGJ9 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
U2af1l4Q8BGJ9 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC27.54■■■□□ 2
U2af1l4Q8BGJ9 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
U2af1l4Q8BGJ9 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
U2af1l4Q8BGJ9 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
U2af1l4Q8BGJ9 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
U2af1l4Q8BGJ9 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
U2af1l4Q8BGJ9 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
U2af1l4Q8BGJ9 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
U2af1l4Q8BGJ9 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
U2af1l4Q8BGJ9 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
U2af1l4Q8BGJ9 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC27.51■■■□□ 2
U2af1l4Q8BGJ9 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC27.51■■□□□ 1.99
U2af1l4Q8BGJ9 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
U2af1l4Q8BGJ9 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
U2af1l4Q8BGJ9 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
U2af1l4Q8BGJ9 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
U2af1l4Q8BGJ9 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
U2af1l4Q8BGJ9 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
U2af1l4Q8BGJ9 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
U2af1l4Q8BGJ9 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
U2af1l4Q8BGJ9 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC27.49■■□□□ 1.99
U2af1l4Q8BGJ9 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
U2af1l4Q8BGJ9 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
U2af1l4Q8BGJ9 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
U2af1l4Q8BGJ9 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
U2af1l4Q8BGJ9 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
U2af1l4Q8BGJ9 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
U2af1l4Q8BGJ9 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
U2af1l4Q8BGJ9 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
U2af1l4Q8BGJ9 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
U2af1l4Q8BGJ9 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC27.46■■□□□ 1.99
U2af1l4Q8BGJ9 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC27.46■■□□□ 1.99
U2af1l4Q8BGJ9 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
U2af1l4Q8BGJ9 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
U2af1l4Q8BGJ9 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC27.44■■□□□ 1.98
U2af1l4Q8BGJ9 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.7 ms