Protein–RNA interactions for Protein: Q8BG67

Efr3a, Protein EFR3 homolog A, mousemouse

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Length 819 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efr3aQ8BG67 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Efr3aQ8BG67 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Efr3aQ8BG67 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Efr3aQ8BG67 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Efr3aQ8BG67 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Efr3aQ8BG67 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Efr3aQ8BG67 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Efr3aQ8BG67 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Efr3aQ8BG67 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Efr3aQ8BG67 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Efr3aQ8BG67 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Efr3aQ8BG67 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Efr3aQ8BG67 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Efr3aQ8BG67 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Efr3aQ8BG67 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Efr3aQ8BG67 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Efr3aQ8BG67 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Efr3aQ8BG67 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Efr3aQ8BG67 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Efr3aQ8BG67 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Efr3aQ8BG67 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Efr3aQ8BG67 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Efr3aQ8BG67 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Efr3aQ8BG67 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Efr3aQ8BG67 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Efr3aQ8BG67 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Efr3aQ8BG67 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Efr3aQ8BG67 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Efr3aQ8BG67 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Efr3aQ8BG67 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Efr3aQ8BG67 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Efr3aQ8BG67 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Efr3aQ8BG67 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Efr3aQ8BG67 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Efr3aQ8BG67 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Efr3aQ8BG67 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Efr3aQ8BG67 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Efr3aQ8BG67 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Efr3aQ8BG67 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Efr3aQ8BG67 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Efr3aQ8BG67 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Efr3aQ8BG67 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Efr3aQ8BG67 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Efr3aQ8BG67 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Efr3aQ8BG67 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Efr3aQ8BG67 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Efr3aQ8BG67 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Efr3aQ8BG67 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Efr3aQ8BG67 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Efr3aQ8BG67 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Efr3aQ8BG67 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Efr3aQ8BG67 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Efr3aQ8BG67 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Efr3aQ8BG67 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Efr3aQ8BG67 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Efr3aQ8BG67 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Efr3aQ8BG67 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Efr3aQ8BG67 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Efr3aQ8BG67 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Efr3aQ8BG67 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Efr3aQ8BG67 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Efr3aQ8BG67 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Efr3aQ8BG67 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Efr3aQ8BG67 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Efr3aQ8BG67 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Efr3aQ8BG67 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Efr3aQ8BG67 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Efr3aQ8BG67 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Efr3aQ8BG67 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Efr3aQ8BG67 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Efr3aQ8BG67 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Efr3aQ8BG67 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Efr3aQ8BG67 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Efr3aQ8BG67 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Efr3aQ8BG67 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Efr3aQ8BG67 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Efr3aQ8BG67 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Efr3aQ8BG67 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Efr3aQ8BG67 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Efr3aQ8BG67 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Efr3aQ8BG67 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Efr3aQ8BG67 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Efr3aQ8BG67 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Efr3aQ8BG67 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Efr3aQ8BG67 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Efr3aQ8BG67 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Efr3aQ8BG67 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Efr3aQ8BG67 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Efr3aQ8BG67 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Efr3aQ8BG67 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Efr3aQ8BG67 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Efr3aQ8BG67 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Efr3aQ8BG67 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Efr3aQ8BG67 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Efr3aQ8BG67 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Efr3aQ8BG67 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Efr3aQ8BG67 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Efr3aQ8BG67 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Efr3aQ8BG67 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Efr3aQ8BG67 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 129.8 ms