Protein–RNA interactions for Protein: Q8BG40

Katnb1, Katanin p80 WD40 repeat-containing subunit B1, mousemouse

Predictions only

Length 658 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Katnb1Q8BG40 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Katnb1Q8BG40 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Katnb1Q8BG40 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Katnb1Q8BG40 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Katnb1Q8BG40 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Katnb1Q8BG40 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Katnb1Q8BG40 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Katnb1Q8BG40 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Katnb1Q8BG40 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Katnb1Q8BG40 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Katnb1Q8BG40 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Katnb1Q8BG40 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Katnb1Q8BG40 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Katnb1Q8BG40 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Katnb1Q8BG40 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Katnb1Q8BG40 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Katnb1Q8BG40 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Katnb1Q8BG40 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Katnb1Q8BG40 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Katnb1Q8BG40 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Katnb1Q8BG40 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Katnb1Q8BG40 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Katnb1Q8BG40 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Katnb1Q8BG40 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Katnb1Q8BG40 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Katnb1Q8BG40 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Katnb1Q8BG40 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Katnb1Q8BG40 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Katnb1Q8BG40 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Katnb1Q8BG40 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Katnb1Q8BG40 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Katnb1Q8BG40 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Katnb1Q8BG40 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Katnb1Q8BG40 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Katnb1Q8BG40 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Katnb1Q8BG40 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Katnb1Q8BG40 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Katnb1Q8BG40 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Katnb1Q8BG40 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Katnb1Q8BG40 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Katnb1Q8BG40 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Katnb1Q8BG40 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Katnb1Q8BG40 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Katnb1Q8BG40 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Katnb1Q8BG40 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Katnb1Q8BG40 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Katnb1Q8BG40 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Katnb1Q8BG40 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Katnb1Q8BG40 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Katnb1Q8BG40 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Katnb1Q8BG40 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Katnb1Q8BG40 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Katnb1Q8BG40 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Katnb1Q8BG40 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Katnb1Q8BG40 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Katnb1Q8BG40 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Katnb1Q8BG40 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Katnb1Q8BG40 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Katnb1Q8BG40 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Katnb1Q8BG40 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Katnb1Q8BG40 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Katnb1Q8BG40 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Katnb1Q8BG40 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Katnb1Q8BG40 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Katnb1Q8BG40 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Katnb1Q8BG40 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Katnb1Q8BG40 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Katnb1Q8BG40 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Katnb1Q8BG40 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Katnb1Q8BG40 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Katnb1Q8BG40 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Katnb1Q8BG40 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Katnb1Q8BG40 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Katnb1Q8BG40 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Katnb1Q8BG40 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Katnb1Q8BG40 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Katnb1Q8BG40 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Katnb1Q8BG40 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Katnb1Q8BG40 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Katnb1Q8BG40 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Katnb1Q8BG40 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Katnb1Q8BG40 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Katnb1Q8BG40 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Katnb1Q8BG40 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Katnb1Q8BG40 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Katnb1Q8BG40 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Katnb1Q8BG40 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Katnb1Q8BG40 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Katnb1Q8BG40 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Katnb1Q8BG40 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Katnb1Q8BG40 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Katnb1Q8BG40 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Katnb1Q8BG40 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Katnb1Q8BG40 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Katnb1Q8BG40 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Katnb1Q8BG40 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Katnb1Q8BG40 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Katnb1Q8BG40 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Katnb1Q8BG40 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Katnb1Q8BG40 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.9 ms