Protein–RNA interactions for Protein: Q8BG18

Necab1, N-terminal EF-hand calcium-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Necab1Q8BG18 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Necab1Q8BG18 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Necab1Q8BG18 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Necab1Q8BG18 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Necab1Q8BG18 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Necab1Q8BG18 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Necab1Q8BG18 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Necab1Q8BG18 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Necab1Q8BG18 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Necab1Q8BG18 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Necab1Q8BG18 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Necab1Q8BG18 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Necab1Q8BG18 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Necab1Q8BG18 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Necab1Q8BG18 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Necab1Q8BG18 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Necab1Q8BG18 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Necab1Q8BG18 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Necab1Q8BG18 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Necab1Q8BG18 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Necab1Q8BG18 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Necab1Q8BG18 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Necab1Q8BG18 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Necab1Q8BG18 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Necab1Q8BG18 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Necab1Q8BG18 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Necab1Q8BG18 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Necab1Q8BG18 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Necab1Q8BG18 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Necab1Q8BG18 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Necab1Q8BG18 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Necab1Q8BG18 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Necab1Q8BG18 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Necab1Q8BG18 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Necab1Q8BG18 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Necab1Q8BG18 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Necab1Q8BG18 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Necab1Q8BG18 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Necab1Q8BG18 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
Necab1Q8BG18 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Necab1Q8BG18 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Necab1Q8BG18 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Necab1Q8BG18 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Necab1Q8BG18 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Necab1Q8BG18 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Necab1Q8BG18 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Necab1Q8BG18 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Necab1Q8BG18 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Necab1Q8BG18 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Necab1Q8BG18 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Necab1Q8BG18 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Necab1Q8BG18 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Necab1Q8BG18 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Necab1Q8BG18 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Necab1Q8BG18 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Necab1Q8BG18 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
Necab1Q8BG18 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Necab1Q8BG18 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Necab1Q8BG18 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Necab1Q8BG18 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Necab1Q8BG18 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Necab1Q8BG18 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Necab1Q8BG18 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Necab1Q8BG18 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Necab1Q8BG18 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Necab1Q8BG18 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Necab1Q8BG18 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Necab1Q8BG18 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Necab1Q8BG18 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Necab1Q8BG18 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Necab1Q8BG18 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Necab1Q8BG18 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Necab1Q8BG18 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Necab1Q8BG18 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Necab1Q8BG18 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Necab1Q8BG18 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
Necab1Q8BG18 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Necab1Q8BG18 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Necab1Q8BG18 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Necab1Q8BG18 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Necab1Q8BG18 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Necab1Q8BG18 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Necab1Q8BG18 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Necab1Q8BG18 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Necab1Q8BG18 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Necab1Q8BG18 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Necab1Q8BG18 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Necab1Q8BG18 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Necab1Q8BG18 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Necab1Q8BG18 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Necab1Q8BG18 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Necab1Q8BG18 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Necab1Q8BG18 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Necab1Q8BG18 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Necab1Q8BG18 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Necab1Q8BG18 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Necab1Q8BG18 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
Necab1Q8BG18 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Necab1Q8BG18 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Necab1Q8BG18 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms