Protein–RNA interactions for Protein: Q80ZJ6

Zer1, Protein zer-1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 779 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zer1Q80ZJ6 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Zer1Q80ZJ6 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Zer1Q80ZJ6 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Zer1Q80ZJ6 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Zer1Q80ZJ6 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Zer1Q80ZJ6 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Zer1Q80ZJ6 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Zer1Q80ZJ6 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Zer1Q80ZJ6 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Zer1Q80ZJ6 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Zer1Q80ZJ6 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Zer1Q80ZJ6 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Zer1Q80ZJ6 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Zer1Q80ZJ6 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Zer1Q80ZJ6 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Zer1Q80ZJ6 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Zer1Q80ZJ6 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Zer1Q80ZJ6 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Zer1Q80ZJ6 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Zer1Q80ZJ6 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Zer1Q80ZJ6 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Zer1Q80ZJ6 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Zer1Q80ZJ6 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Zer1Q80ZJ6 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Zer1Q80ZJ6 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Zer1Q80ZJ6 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Zer1Q80ZJ6 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Zer1Q80ZJ6 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Zer1Q80ZJ6 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Zer1Q80ZJ6 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Zer1Q80ZJ6 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Zer1Q80ZJ6 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Zer1Q80ZJ6 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Zer1Q80ZJ6 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Zer1Q80ZJ6 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Zer1Q80ZJ6 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Zer1Q80ZJ6 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Zer1Q80ZJ6 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Zer1Q80ZJ6 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Zer1Q80ZJ6 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Zer1Q80ZJ6 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Zer1Q80ZJ6 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Zer1Q80ZJ6 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Zer1Q80ZJ6 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Zer1Q80ZJ6 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Zer1Q80ZJ6 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Zer1Q80ZJ6 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Zer1Q80ZJ6 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Zer1Q80ZJ6 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Zer1Q80ZJ6 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Zer1Q80ZJ6 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Zer1Q80ZJ6 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Zer1Q80ZJ6 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Zer1Q80ZJ6 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Zer1Q80ZJ6 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Zer1Q80ZJ6 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Zer1Q80ZJ6 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Zer1Q80ZJ6 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Zer1Q80ZJ6 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Zer1Q80ZJ6 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Zer1Q80ZJ6 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Zer1Q80ZJ6 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Zer1Q80ZJ6 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Zer1Q80ZJ6 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Zer1Q80ZJ6 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Zer1Q80ZJ6 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Zer1Q80ZJ6 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Zer1Q80ZJ6 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Zer1Q80ZJ6 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Zer1Q80ZJ6 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Zer1Q80ZJ6 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Zer1Q80ZJ6 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Zer1Q80ZJ6 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Zer1Q80ZJ6 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Zer1Q80ZJ6 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Zer1Q80ZJ6 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Zer1Q80ZJ6 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Zer1Q80ZJ6 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Zer1Q80ZJ6 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Zer1Q80ZJ6 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Zer1Q80ZJ6 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Zer1Q80ZJ6 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Zer1Q80ZJ6 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Zer1Q80ZJ6 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Zer1Q80ZJ6 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Zer1Q80ZJ6 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Zer1Q80ZJ6 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Zer1Q80ZJ6 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Zer1Q80ZJ6 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Zer1Q80ZJ6 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Zer1Q80ZJ6 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Zer1Q80ZJ6 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Zer1Q80ZJ6 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Zer1Q80ZJ6 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Zer1Q80ZJ6 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Zer1Q80ZJ6 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Zer1Q80ZJ6 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Zer1Q80ZJ6 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Zer1Q80ZJ6 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Zer1Q80ZJ6 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.2 ms