Protein–RNA interactions for Protein: Q80X53

Ccdc116, Coiled-coil domain-containing protein 116, mousemouse

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc116Q80X53 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ccdc116Q80X53 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ccdc116Q80X53 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ccdc116Q80X53 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ccdc116Q80X53 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ccdc116Q80X53 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ccdc116Q80X53 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ccdc116Q80X53 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ccdc116Q80X53 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ccdc116Q80X53 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ccdc116Q80X53 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ccdc116Q80X53 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ccdc116Q80X53 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ccdc116Q80X53 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ccdc116Q80X53 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ccdc116Q80X53 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ccdc116Q80X53 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ccdc116Q80X53 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ccdc116Q80X53 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ccdc116Q80X53 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ccdc116Q80X53 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ccdc116Q80X53 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ccdc116Q80X53 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ccdc116Q80X53 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ccdc116Q80X53 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ccdc116Q80X53 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ccdc116Q80X53 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ccdc116Q80X53 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ccdc116Q80X53 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Ccdc116Q80X53 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Ccdc116Q80X53 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ccdc116Q80X53 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccdc116Q80X53 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccdc116Q80X53 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccdc116Q80X53 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccdc116Q80X53 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccdc116Q80X53 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccdc116Q80X53 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccdc116Q80X53 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccdc116Q80X53 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccdc116Q80X53 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ccdc116Q80X53 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ccdc116Q80X53 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccdc116Q80X53 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccdc116Q80X53 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ccdc116Q80X53 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ccdc116Q80X53 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ccdc116Q80X53 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ccdc116Q80X53 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ccdc116Q80X53 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ccdc116Q80X53 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ccdc116Q80X53 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ccdc116Q80X53 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccdc116Q80X53 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccdc116Q80X53 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccdc116Q80X53 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ccdc116Q80X53 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ccdc116Q80X53 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccdc116Q80X53 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccdc116Q80X53 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccdc116Q80X53 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ccdc116Q80X53 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccdc116Q80X53 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccdc116Q80X53 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccdc116Q80X53 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccdc116Q80X53 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccdc116Q80X53 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccdc116Q80X53 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccdc116Q80X53 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ccdc116Q80X53 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccdc116Q80X53 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccdc116Q80X53 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccdc116Q80X53 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ccdc116Q80X53 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Ccdc116Q80X53 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ccdc116Q80X53 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccdc116Q80X53 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccdc116Q80X53 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccdc116Q80X53 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccdc116Q80X53 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccdc116Q80X53 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccdc116Q80X53 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccdc116Q80X53 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccdc116Q80X53 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccdc116Q80X53 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccdc116Q80X53 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccdc116Q80X53 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccdc116Q80X53 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccdc116Q80X53 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccdc116Q80X53 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Ccdc116Q80X53 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ccdc116Q80X53 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ccdc116Q80X53 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ccdc116Q80X53 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ccdc116Q80X53 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ccdc116Q80X53 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ccdc116Q80X53 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Ccdc116Q80X53 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ccdc116Q80X53 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ccdc116Q80X53 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10 ms