Protein–RNA interactions for Protein: Q80WV7

Srrm3, Serine/arginine repetitive matrix protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 648 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srrm3Q80WV7 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Srrm3Q80WV7 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Srrm3Q80WV7 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Srrm3Q80WV7 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Srrm3Q80WV7 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Srrm3Q80WV7 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Srrm3Q80WV7 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Srrm3Q80WV7 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Srrm3Q80WV7 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
Srrm3Q80WV7 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Srrm3Q80WV7 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Srrm3Q80WV7 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Srrm3Q80WV7 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Srrm3Q80WV7 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Srrm3Q80WV7 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Srrm3Q80WV7 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Srrm3Q80WV7 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Srrm3Q80WV7 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Srrm3Q80WV7 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Srrm3Q80WV7 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Srrm3Q80WV7 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Srrm3Q80WV7 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Srrm3Q80WV7 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Srrm3Q80WV7 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Srrm3Q80WV7 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Srrm3Q80WV7 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Srrm3Q80WV7 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Srrm3Q80WV7 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Srrm3Q80WV7 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Srrm3Q80WV7 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Srrm3Q80WV7 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Srrm3Q80WV7 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Srrm3Q80WV7 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Srrm3Q80WV7 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Srrm3Q80WV7 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Srrm3Q80WV7 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Srrm3Q80WV7 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Srrm3Q80WV7 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Srrm3Q80WV7 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Srrm3Q80WV7 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Srrm3Q80WV7 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Srrm3Q80WV7 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Srrm3Q80WV7 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Srrm3Q80WV7 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Srrm3Q80WV7 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Srrm3Q80WV7 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.48
Srrm3Q80WV7 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Srrm3Q80WV7 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Srrm3Q80WV7 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Srrm3Q80WV7 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Srrm3Q80WV7 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Srrm3Q80WV7 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Srrm3Q80WV7 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Srrm3Q80WV7 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Srrm3Q80WV7 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Srrm3Q80WV7 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Srrm3Q80WV7 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Srrm3Q80WV7 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Srrm3Q80WV7 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Srrm3Q80WV7 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Srrm3Q80WV7 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Srrm3Q80WV7 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Srrm3Q80WV7 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Srrm3Q80WV7 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Srrm3Q80WV7 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Srrm3Q80WV7 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Srrm3Q80WV7 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Srrm3Q80WV7 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Srrm3Q80WV7 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Srrm3Q80WV7 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Srrm3Q80WV7 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Srrm3Q80WV7 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Srrm3Q80WV7 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Srrm3Q80WV7 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Srrm3Q80WV7 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Srrm3Q80WV7 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Srrm3Q80WV7 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Srrm3Q80WV7 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Srrm3Q80WV7 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Srrm3Q80WV7 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Srrm3Q80WV7 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Srrm3Q80WV7 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Srrm3Q80WV7 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Srrm3Q80WV7 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Srrm3Q80WV7 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Srrm3Q80WV7 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Srrm3Q80WV7 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Srrm3Q80WV7 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Srrm3Q80WV7 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Srrm3Q80WV7 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
Srrm3Q80WV7 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Srrm3Q80WV7 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Srrm3Q80WV7 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Srrm3Q80WV7 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Srrm3Q80WV7 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Srrm3Q80WV7 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Srrm3Q80WV7 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Srrm3Q80WV7 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Srrm3Q80WV7 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Srrm3Q80WV7 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms