Protein–RNA interactions for Protein: Q80UY2

Kcmf1, E3 ubiquitin-protein ligase KCMF1, mousemouse

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcmf1Q80UY2 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Kcmf1Q80UY2 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Kcmf1Q80UY2 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Kcmf1Q80UY2 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Kcmf1Q80UY2 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Kcmf1Q80UY2 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Kcmf1Q80UY2 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Kcmf1Q80UY2 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Kcmf1Q80UY2 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Kcmf1Q80UY2 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Kcmf1Q80UY2 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Kcmf1Q80UY2 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Kcmf1Q80UY2 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Kcmf1Q80UY2 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Kcmf1Q80UY2 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Kcmf1Q80UY2 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Kcmf1Q80UY2 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Kcmf1Q80UY2 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Kcmf1Q80UY2 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Kcmf1Q80UY2 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Kcmf1Q80UY2 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Kcmf1Q80UY2 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Kcmf1Q80UY2 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Kcmf1Q80UY2 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Kcmf1Q80UY2 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Kcmf1Q80UY2 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Kcmf1Q80UY2 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Kcmf1Q80UY2 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Kcmf1Q80UY2 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Kcmf1Q80UY2 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Kcmf1Q80UY2 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Kcmf1Q80UY2 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Kcmf1Q80UY2 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Kcmf1Q80UY2 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Kcmf1Q80UY2 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Kcmf1Q80UY2 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Kcmf1Q80UY2 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Kcmf1Q80UY2 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Kcmf1Q80UY2 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Kcmf1Q80UY2 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Kcmf1Q80UY2 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Kcmf1Q80UY2 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Kcmf1Q80UY2 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Kcmf1Q80UY2 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Kcmf1Q80UY2 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Kcmf1Q80UY2 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Kcmf1Q80UY2 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Kcmf1Q80UY2 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Kcmf1Q80UY2 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Kcmf1Q80UY2 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Kcmf1Q80UY2 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Kcmf1Q80UY2 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Kcmf1Q80UY2 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Kcmf1Q80UY2 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Kcmf1Q80UY2 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Kcmf1Q80UY2 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Kcmf1Q80UY2 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Kcmf1Q80UY2 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Kcmf1Q80UY2 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Kcmf1Q80UY2 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Kcmf1Q80UY2 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Kcmf1Q80UY2 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Kcmf1Q80UY2 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Kcmf1Q80UY2 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Kcmf1Q80UY2 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Kcmf1Q80UY2 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Kcmf1Q80UY2 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Kcmf1Q80UY2 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Kcmf1Q80UY2 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Kcmf1Q80UY2 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Kcmf1Q80UY2 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Kcmf1Q80UY2 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Kcmf1Q80UY2 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Kcmf1Q80UY2 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Kcmf1Q80UY2 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Kcmf1Q80UY2 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Kcmf1Q80UY2 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Kcmf1Q80UY2 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Kcmf1Q80UY2 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Kcmf1Q80UY2 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Kcmf1Q80UY2 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
Kcmf1Q80UY2 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Kcmf1Q80UY2 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Kcmf1Q80UY2 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Kcmf1Q80UY2 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Kcmf1Q80UY2 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Kcmf1Q80UY2 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Kcmf1Q80UY2 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Kcmf1Q80UY2 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Kcmf1Q80UY2 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Kcmf1Q80UY2 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Kcmf1Q80UY2 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Kcmf1Q80UY2 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Kcmf1Q80UY2 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Kcmf1Q80UY2 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Kcmf1Q80UY2 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Kcmf1Q80UY2 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Kcmf1Q80UY2 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Kcmf1Q80UY2 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Kcmf1Q80UY2 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.7 ms