Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSN7

Igsf5, Immunoglobulin superfamily member 5, mousemouse

Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Igsf5Q7TSN7 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Igsf5Q7TSN7 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Igsf5Q7TSN7 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Igsf5Q7TSN7 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Igsf5Q7TSN7 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Igsf5Q7TSN7 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Igsf5Q7TSN7 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Igsf5Q7TSN7 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Igsf5Q7TSN7 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
Igsf5Q7TSN7 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Igsf5Q7TSN7 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Igsf5Q7TSN7 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Igsf5Q7TSN7 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Igsf5Q7TSN7 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Igsf5Q7TSN7 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Igsf5Q7TSN7 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Igsf5Q7TSN7 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Igsf5Q7TSN7 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Igsf5Q7TSN7 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Igsf5Q7TSN7 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Igsf5Q7TSN7 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Igsf5Q7TSN7 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Igsf5Q7TSN7 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Igsf5Q7TSN7 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Igsf5Q7TSN7 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Igsf5Q7TSN7 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Igsf5Q7TSN7 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Igsf5Q7TSN7 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Igsf5Q7TSN7 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Igsf5Q7TSN7 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Igsf5Q7TSN7 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Igsf5Q7TSN7 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Igsf5Q7TSN7 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Igsf5Q7TSN7 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Igsf5Q7TSN7 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Igsf5Q7TSN7 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Igsf5Q7TSN7 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Igsf5Q7TSN7 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Igsf5Q7TSN7 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Igsf5Q7TSN7 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Igsf5Q7TSN7 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Igsf5Q7TSN7 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Igsf5Q7TSN7 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Igsf5Q7TSN7 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Igsf5Q7TSN7 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Igsf5Q7TSN7 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Igsf5Q7TSN7 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Igsf5Q7TSN7 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Igsf5Q7TSN7 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Igsf5Q7TSN7 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Igsf5Q7TSN7 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Igsf5Q7TSN7 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Igsf5Q7TSN7 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Igsf5Q7TSN7 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Igsf5Q7TSN7 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Igsf5Q7TSN7 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Igsf5Q7TSN7 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Igsf5Q7TSN7 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Igsf5Q7TSN7 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Igsf5Q7TSN7 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Igsf5Q7TSN7 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Igsf5Q7TSN7 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Igsf5Q7TSN7 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Igsf5Q7TSN7 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Igsf5Q7TSN7 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Igsf5Q7TSN7 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Igsf5Q7TSN7 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Igsf5Q7TSN7 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Igsf5Q7TSN7 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Igsf5Q7TSN7 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Igsf5Q7TSN7 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Igsf5Q7TSN7 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Igsf5Q7TSN7 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Igsf5Q7TSN7 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Igsf5Q7TSN7 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Igsf5Q7TSN7 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Igsf5Q7TSN7 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Igsf5Q7TSN7 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Igsf5Q7TSN7 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Igsf5Q7TSN7 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Igsf5Q7TSN7 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Igsf5Q7TSN7 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Igsf5Q7TSN7 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Igsf5Q7TSN7 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Igsf5Q7TSN7 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Igsf5Q7TSN7 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Igsf5Q7TSN7 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Igsf5Q7TSN7 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Igsf5Q7TSN7 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Igsf5Q7TSN7 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Igsf5Q7TSN7 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Igsf5Q7TSN7 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Igsf5Q7TSN7 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Igsf5Q7TSN7 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Igsf5Q7TSN7 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Igsf5Q7TSN7 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Igsf5Q7TSN7 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Igsf5Q7TSN7 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Igsf5Q7TSN7 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Igsf5Q7TSN7 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms