Protein–RNA interactions for Protein: Q7JJ13

Brd2, Bromodomain-containing protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brd2Q7JJ13 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Brd2Q7JJ13 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Brd2Q7JJ13 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Brd2Q7JJ13 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Brd2Q7JJ13 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Brd2Q7JJ13 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Brd2Q7JJ13 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Brd2Q7JJ13 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Brd2Q7JJ13 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Brd2Q7JJ13 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Brd2Q7JJ13 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Brd2Q7JJ13 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Brd2Q7JJ13 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Brd2Q7JJ13 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Brd2Q7JJ13 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Brd2Q7JJ13 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
Brd2Q7JJ13 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Brd2Q7JJ13 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Brd2Q7JJ13 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Brd2Q7JJ13 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Brd2Q7JJ13 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
Brd2Q7JJ13 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Brd2Q7JJ13 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
Brd2Q7JJ13 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
Brd2Q7JJ13 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
Brd2Q7JJ13 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Brd2Q7JJ13 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Brd2Q7JJ13 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Brd2Q7JJ13 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Brd2Q7JJ13 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Brd2Q7JJ13 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Brd2Q7JJ13 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Brd2Q7JJ13 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Brd2Q7JJ13 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Brd2Q7JJ13 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Brd2Q7JJ13 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Brd2Q7JJ13 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Brd2Q7JJ13 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Brd2Q7JJ13 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Brd2Q7JJ13 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Brd2Q7JJ13 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Brd2Q7JJ13 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Brd2Q7JJ13 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Brd2Q7JJ13 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Brd2Q7JJ13 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Brd2Q7JJ13 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Brd2Q7JJ13 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Brd2Q7JJ13 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Brd2Q7JJ13 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Brd2Q7JJ13 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Brd2Q7JJ13 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Brd2Q7JJ13 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
Brd2Q7JJ13 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Brd2Q7JJ13 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Brd2Q7JJ13 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Brd2Q7JJ13 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Brd2Q7JJ13 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Brd2Q7JJ13 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
Brd2Q7JJ13 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Brd2Q7JJ13 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Brd2Q7JJ13 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Brd2Q7JJ13 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Brd2Q7JJ13 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Brd2Q7JJ13 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Brd2Q7JJ13 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Brd2Q7JJ13 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Brd2Q7JJ13 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Brd2Q7JJ13 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Brd2Q7JJ13 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Brd2Q7JJ13 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Brd2Q7JJ13 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Brd2Q7JJ13 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
Brd2Q7JJ13 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Brd2Q7JJ13 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Brd2Q7JJ13 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Brd2Q7JJ13 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Brd2Q7JJ13 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Brd2Q7JJ13 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Brd2Q7JJ13 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Brd2Q7JJ13 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Brd2Q7JJ13 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Brd2Q7JJ13 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Brd2Q7JJ13 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
Brd2Q7JJ13 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Brd2Q7JJ13 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Brd2Q7JJ13 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Brd2Q7JJ13 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
Brd2Q7JJ13 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Brd2Q7JJ13 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Brd2Q7JJ13 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Brd2Q7JJ13 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Brd2Q7JJ13 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Brd2Q7JJ13 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Brd2Q7JJ13 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Brd2Q7JJ13 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Brd2Q7JJ13 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Brd2Q7JJ13 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
Brd2Q7JJ13 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
Brd2Q7JJ13 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Brd2Q7JJ13 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.4 ms