Protein–RNA interactions for Protein: Q76I25

Higd1c, HIG1 domain family member 1C, mousemouse

Predictions only

Length 96 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Higd1cQ76I25 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Higd1cQ76I25 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Higd1cQ76I25 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Higd1cQ76I25 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Higd1cQ76I25 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Higd1cQ76I25 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Higd1cQ76I25 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Higd1cQ76I25 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Higd1cQ76I25 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Higd1cQ76I25 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Higd1cQ76I25 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Higd1cQ76I25 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Higd1cQ76I25 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Higd1cQ76I25 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Higd1cQ76I25 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Higd1cQ76I25 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Higd1cQ76I25 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Higd1cQ76I25 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Higd1cQ76I25 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Higd1cQ76I25 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Higd1cQ76I25 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Higd1cQ76I25 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Higd1cQ76I25 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Higd1cQ76I25 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Higd1cQ76I25 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Higd1cQ76I25 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Higd1cQ76I25 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Higd1cQ76I25 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Higd1cQ76I25 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Higd1cQ76I25 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Higd1cQ76I25 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Higd1cQ76I25 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Higd1cQ76I25 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Higd1cQ76I25 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Higd1cQ76I25 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Higd1cQ76I25 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Higd1cQ76I25 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Higd1cQ76I25 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Higd1cQ76I25 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Higd1cQ76I25 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Higd1cQ76I25 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Higd1cQ76I25 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Higd1cQ76I25 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Higd1cQ76I25 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Higd1cQ76I25 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Higd1cQ76I25 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Higd1cQ76I25 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Higd1cQ76I25 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Higd1cQ76I25 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Higd1cQ76I25 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Higd1cQ76I25 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Higd1cQ76I25 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Higd1cQ76I25 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Higd1cQ76I25 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Higd1cQ76I25 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Higd1cQ76I25 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Higd1cQ76I25 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Higd1cQ76I25 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Higd1cQ76I25 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Higd1cQ76I25 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Higd1cQ76I25 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Higd1cQ76I25 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Higd1cQ76I25 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Higd1cQ76I25 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Higd1cQ76I25 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Higd1cQ76I25 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Higd1cQ76I25 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Higd1cQ76I25 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Higd1cQ76I25 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Higd1cQ76I25 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Higd1cQ76I25 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Higd1cQ76I25 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Higd1cQ76I25 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Higd1cQ76I25 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Higd1cQ76I25 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Higd1cQ76I25 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Higd1cQ76I25 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Higd1cQ76I25 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Higd1cQ76I25 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Higd1cQ76I25 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Higd1cQ76I25 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Higd1cQ76I25 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Higd1cQ76I25 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Higd1cQ76I25 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Higd1cQ76I25 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Higd1cQ76I25 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
Higd1cQ76I25 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Higd1cQ76I25 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Higd1cQ76I25 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Higd1cQ76I25 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Higd1cQ76I25 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Higd1cQ76I25 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Higd1cQ76I25 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Higd1cQ76I25 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Higd1cQ76I25 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Higd1cQ76I25 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Higd1cQ76I25 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Higd1cQ76I25 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Higd1cQ76I25 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Higd1cQ76I25 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 103 ms