Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZWS8

Spop, Speckle-type POZ protein, mousemouse

Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SpopQ6ZWS8 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SpopQ6ZWS8 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SpopQ6ZWS8 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SpopQ6ZWS8 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SpopQ6ZWS8 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SpopQ6ZWS8 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SpopQ6ZWS8 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SpopQ6ZWS8 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SpopQ6ZWS8 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SpopQ6ZWS8 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SpopQ6ZWS8 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SpopQ6ZWS8 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SpopQ6ZWS8 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SpopQ6ZWS8 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SpopQ6ZWS8 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SpopQ6ZWS8 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SpopQ6ZWS8 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SpopQ6ZWS8 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SpopQ6ZWS8 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SpopQ6ZWS8 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SpopQ6ZWS8 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SpopQ6ZWS8 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SpopQ6ZWS8 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SpopQ6ZWS8 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SpopQ6ZWS8 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SpopQ6ZWS8 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SpopQ6ZWS8 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SpopQ6ZWS8 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SpopQ6ZWS8 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SpopQ6ZWS8 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
SpopQ6ZWS8 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SpopQ6ZWS8 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SpopQ6ZWS8 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SpopQ6ZWS8 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SpopQ6ZWS8 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SpopQ6ZWS8 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SpopQ6ZWS8 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
SpopQ6ZWS8 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SpopQ6ZWS8 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SpopQ6ZWS8 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SpopQ6ZWS8 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SpopQ6ZWS8 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SpopQ6ZWS8 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SpopQ6ZWS8 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SpopQ6ZWS8 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SpopQ6ZWS8 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SpopQ6ZWS8 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SpopQ6ZWS8 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SpopQ6ZWS8 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SpopQ6ZWS8 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SpopQ6ZWS8 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SpopQ6ZWS8 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SpopQ6ZWS8 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SpopQ6ZWS8 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SpopQ6ZWS8 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SpopQ6ZWS8 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SpopQ6ZWS8 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SpopQ6ZWS8 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SpopQ6ZWS8 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SpopQ6ZWS8 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SpopQ6ZWS8 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SpopQ6ZWS8 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SpopQ6ZWS8 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SpopQ6ZWS8 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SpopQ6ZWS8 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SpopQ6ZWS8 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SpopQ6ZWS8 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SpopQ6ZWS8 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
SpopQ6ZWS8 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SpopQ6ZWS8 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SpopQ6ZWS8 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SpopQ6ZWS8 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SpopQ6ZWS8 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
SpopQ6ZWS8 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SpopQ6ZWS8 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
SpopQ6ZWS8 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
SpopQ6ZWS8 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SpopQ6ZWS8 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SpopQ6ZWS8 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SpopQ6ZWS8 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SpopQ6ZWS8 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SpopQ6ZWS8 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SpopQ6ZWS8 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SpopQ6ZWS8 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SpopQ6ZWS8 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SpopQ6ZWS8 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SpopQ6ZWS8 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SpopQ6ZWS8 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SpopQ6ZWS8 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SpopQ6ZWS8 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SpopQ6ZWS8 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SpopQ6ZWS8 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SpopQ6ZWS8 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SpopQ6ZWS8 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SpopQ6ZWS8 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SpopQ6ZWS8 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SpopQ6ZWS8 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SpopQ6ZWS8 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SpopQ6ZWS8 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SpopQ6ZWS8 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 309 ms