Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQM0

Rffl, E3 ubiquitin-protein ligase rififylin, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RfflQ6ZQM0 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RfflQ6ZQM0 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RfflQ6ZQM0 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RfflQ6ZQM0 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RfflQ6ZQM0 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RfflQ6ZQM0 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RfflQ6ZQM0 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RfflQ6ZQM0 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RfflQ6ZQM0 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RfflQ6ZQM0 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RfflQ6ZQM0 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RfflQ6ZQM0 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RfflQ6ZQM0 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RfflQ6ZQM0 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RfflQ6ZQM0 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RfflQ6ZQM0 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RfflQ6ZQM0 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RfflQ6ZQM0 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RfflQ6ZQM0 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RfflQ6ZQM0 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RfflQ6ZQM0 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RfflQ6ZQM0 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RfflQ6ZQM0 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RfflQ6ZQM0 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RfflQ6ZQM0 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RfflQ6ZQM0 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RfflQ6ZQM0 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RfflQ6ZQM0 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RfflQ6ZQM0 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RfflQ6ZQM0 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RfflQ6ZQM0 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RfflQ6ZQM0 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RfflQ6ZQM0 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RfflQ6ZQM0 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RfflQ6ZQM0 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RfflQ6ZQM0 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RfflQ6ZQM0 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RfflQ6ZQM0 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RfflQ6ZQM0 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RfflQ6ZQM0 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RfflQ6ZQM0 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RfflQ6ZQM0 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RfflQ6ZQM0 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RfflQ6ZQM0 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RfflQ6ZQM0 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RfflQ6ZQM0 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RfflQ6ZQM0 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RfflQ6ZQM0 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RfflQ6ZQM0 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RfflQ6ZQM0 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RfflQ6ZQM0 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RfflQ6ZQM0 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RfflQ6ZQM0 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RfflQ6ZQM0 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RfflQ6ZQM0 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RfflQ6ZQM0 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RfflQ6ZQM0 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RfflQ6ZQM0 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RfflQ6ZQM0 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RfflQ6ZQM0 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RfflQ6ZQM0 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RfflQ6ZQM0 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
RfflQ6ZQM0 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RfflQ6ZQM0 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RfflQ6ZQM0 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RfflQ6ZQM0 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RfflQ6ZQM0 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RfflQ6ZQM0 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RfflQ6ZQM0 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RfflQ6ZQM0 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RfflQ6ZQM0 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RfflQ6ZQM0 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RfflQ6ZQM0 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RfflQ6ZQM0 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RfflQ6ZQM0 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RfflQ6ZQM0 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RfflQ6ZQM0 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RfflQ6ZQM0 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RfflQ6ZQM0 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RfflQ6ZQM0 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RfflQ6ZQM0 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RfflQ6ZQM0 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RfflQ6ZQM0 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RfflQ6ZQM0 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RfflQ6ZQM0 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RfflQ6ZQM0 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
RfflQ6ZQM0 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RfflQ6ZQM0 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RfflQ6ZQM0 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RfflQ6ZQM0 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RfflQ6ZQM0 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RfflQ6ZQM0 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RfflQ6ZQM0 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RfflQ6ZQM0 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RfflQ6ZQM0 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RfflQ6ZQM0 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RfflQ6ZQM0 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RfflQ6ZQM0 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RfflQ6ZQM0 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RfflQ6ZQM0 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.1 ms