Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQ11

Chsy1, Chondroitin sulfate synthase 1, mousemouse

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Length 800 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chsy1Q6ZQ11 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Chsy1Q6ZQ11 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Chsy1Q6ZQ11 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Chsy1Q6ZQ11 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Chsy1Q6ZQ11 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Chsy1Q6ZQ11 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Chsy1Q6ZQ11 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Chsy1Q6ZQ11 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Chsy1Q6ZQ11 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Chsy1Q6ZQ11 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Chsy1Q6ZQ11 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Chsy1Q6ZQ11 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Chsy1Q6ZQ11 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Chsy1Q6ZQ11 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Chsy1Q6ZQ11 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Chsy1Q6ZQ11 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Chsy1Q6ZQ11 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Chsy1Q6ZQ11 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Chsy1Q6ZQ11 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Chsy1Q6ZQ11 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Chsy1Q6ZQ11 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Chsy1Q6ZQ11 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Chsy1Q6ZQ11 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Chsy1Q6ZQ11 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Chsy1Q6ZQ11 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Chsy1Q6ZQ11 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Chsy1Q6ZQ11 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Chsy1Q6ZQ11 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Chsy1Q6ZQ11 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
Chsy1Q6ZQ11 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Chsy1Q6ZQ11 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Chsy1Q6ZQ11 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Chsy1Q6ZQ11 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Chsy1Q6ZQ11 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Chsy1Q6ZQ11 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Chsy1Q6ZQ11 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Chsy1Q6ZQ11 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Chsy1Q6ZQ11 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Chsy1Q6ZQ11 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Chsy1Q6ZQ11 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Chsy1Q6ZQ11 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Chsy1Q6ZQ11 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Chsy1Q6ZQ11 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Chsy1Q6ZQ11 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Chsy1Q6ZQ11 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Chsy1Q6ZQ11 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Chsy1Q6ZQ11 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Chsy1Q6ZQ11 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Chsy1Q6ZQ11 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Chsy1Q6ZQ11 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Chsy1Q6ZQ11 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Chsy1Q6ZQ11 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Chsy1Q6ZQ11 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Chsy1Q6ZQ11 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Chsy1Q6ZQ11 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Chsy1Q6ZQ11 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Chsy1Q6ZQ11 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Chsy1Q6ZQ11 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Chsy1Q6ZQ11 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Chsy1Q6ZQ11 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Chsy1Q6ZQ11 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Chsy1Q6ZQ11 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Chsy1Q6ZQ11 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Chsy1Q6ZQ11 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Chsy1Q6ZQ11 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Chsy1Q6ZQ11 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Chsy1Q6ZQ11 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Chsy1Q6ZQ11 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Chsy1Q6ZQ11 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Chsy1Q6ZQ11 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Chsy1Q6ZQ11 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Chsy1Q6ZQ11 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Chsy1Q6ZQ11 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Chsy1Q6ZQ11 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Chsy1Q6ZQ11 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Chsy1Q6ZQ11 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Chsy1Q6ZQ11 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Chsy1Q6ZQ11 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Chsy1Q6ZQ11 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Chsy1Q6ZQ11 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Chsy1Q6ZQ11 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Chsy1Q6ZQ11 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Chsy1Q6ZQ11 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Chsy1Q6ZQ11 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Chsy1Q6ZQ11 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Chsy1Q6ZQ11 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Chsy1Q6ZQ11 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Chsy1Q6ZQ11 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Chsy1Q6ZQ11 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Chsy1Q6ZQ11 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Chsy1Q6ZQ11 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Chsy1Q6ZQ11 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Chsy1Q6ZQ11 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Chsy1Q6ZQ11 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Chsy1Q6ZQ11 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Chsy1Q6ZQ11 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Chsy1Q6ZQ11 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Chsy1Q6ZQ11 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Chsy1Q6ZQ11 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Chsy1Q6ZQ11 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 263.9 ms