Protein–RNA interactions for Protein: Q6XJV4

Cd200r4, Cell surface glycoprotein CD200 receptor 4, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd200r4Q6XJV4 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cd200r4Q6XJV4 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cd200r4Q6XJV4 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cd200r4Q6XJV4 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cd200r4Q6XJV4 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cd200r4Q6XJV4 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cd200r4Q6XJV4 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cd200r4Q6XJV4 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Cd200r4Q6XJV4 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cd200r4Q6XJV4 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cd200r4Q6XJV4 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Cd200r4Q6XJV4 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cd200r4Q6XJV4 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cd200r4Q6XJV4 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Cd200r4Q6XJV4 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Cd200r4Q6XJV4 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Cd200r4Q6XJV4 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cd200r4Q6XJV4 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cd200r4Q6XJV4 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cd200r4Q6XJV4 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cd200r4Q6XJV4 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cd200r4Q6XJV4 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cd200r4Q6XJV4 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cd200r4Q6XJV4 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cd200r4Q6XJV4 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cd200r4Q6XJV4 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cd200r4Q6XJV4 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cd200r4Q6XJV4 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cd200r4Q6XJV4 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cd200r4Q6XJV4 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cd200r4Q6XJV4 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Cd200r4Q6XJV4 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Cd200r4Q6XJV4 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Cd200r4Q6XJV4 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Cd200r4Q6XJV4 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Cd200r4Q6XJV4 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Cd200r4Q6XJV4 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Cd200r4Q6XJV4 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Cd200r4Q6XJV4 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Cd200r4Q6XJV4 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Cd200r4Q6XJV4 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Cd200r4Q6XJV4 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Cd200r4Q6XJV4 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Cd200r4Q6XJV4 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Cd200r4Q6XJV4 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Cd200r4Q6XJV4 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Cd200r4Q6XJV4 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Cd200r4Q6XJV4 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Cd200r4Q6XJV4 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Cd200r4Q6XJV4 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Cd200r4Q6XJV4 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Cd200r4Q6XJV4 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Cd200r4Q6XJV4 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Cd200r4Q6XJV4 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Cd200r4Q6XJV4 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Cd200r4Q6XJV4 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Cd200r4Q6XJV4 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Cd200r4Q6XJV4 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Cd200r4Q6XJV4 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Cd200r4Q6XJV4 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Cd200r4Q6XJV4 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Cd200r4Q6XJV4 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Cd200r4Q6XJV4 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Cd200r4Q6XJV4 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Cd200r4Q6XJV4 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Cd200r4Q6XJV4 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Cd200r4Q6XJV4 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cd200r4Q6XJV4 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cd200r4Q6XJV4 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cd200r4Q6XJV4 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cd200r4Q6XJV4 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cd200r4Q6XJV4 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cd200r4Q6XJV4 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cd200r4Q6XJV4 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cd200r4Q6XJV4 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cd200r4Q6XJV4 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cd200r4Q6XJV4 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cd200r4Q6XJV4 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cd200r4Q6XJV4 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cd200r4Q6XJV4 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cd200r4Q6XJV4 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cd200r4Q6XJV4 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cd200r4Q6XJV4 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cd200r4Q6XJV4 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cd200r4Q6XJV4 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cd200r4Q6XJV4 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC18.77■□□□□ 0.59
Cd200r4Q6XJV4 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cd200r4Q6XJV4 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cd200r4Q6XJV4 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cd200r4Q6XJV4 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cd200r4Q6XJV4 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cd200r4Q6XJV4 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cd200r4Q6XJV4 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cd200r4Q6XJV4 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cd200r4Q6XJV4 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cd200r4Q6XJV4 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cd200r4Q6XJV4 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cd200r4Q6XJV4 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cd200r4Q6XJV4 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cd200r4Q6XJV4 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.1 ms