Protein–RNA interactions for Protein: Q6XAS4

Ssxb3, SSXB3 protein, mousemouse

Predictions only

Length 170 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssxb3Q6XAS4 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ssxb3Q6XAS4 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ssxb3Q6XAS4 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ssxb3Q6XAS4 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ssxb3Q6XAS4 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ssxb3Q6XAS4 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ssxb3Q6XAS4 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ssxb3Q6XAS4 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ssxb3Q6XAS4 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Ssxb3Q6XAS4 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ssxb3Q6XAS4 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ssxb3Q6XAS4 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ssxb3Q6XAS4 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ssxb3Q6XAS4 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ssxb3Q6XAS4 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ssxb3Q6XAS4 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ssxb3Q6XAS4 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ssxb3Q6XAS4 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ssxb3Q6XAS4 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ssxb3Q6XAS4 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ssxb3Q6XAS4 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ssxb3Q6XAS4 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ssxb3Q6XAS4 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ssxb3Q6XAS4 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ssxb3Q6XAS4 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ssxb3Q6XAS4 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ssxb3Q6XAS4 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ssxb3Q6XAS4 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ssxb3Q6XAS4 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ssxb3Q6XAS4 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ssxb3Q6XAS4 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ssxb3Q6XAS4 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ssxb3Q6XAS4 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ssxb3Q6XAS4 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ssxb3Q6XAS4 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ssxb3Q6XAS4 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ssxb3Q6XAS4 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ssxb3Q6XAS4 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ssxb3Q6XAS4 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ssxb3Q6XAS4 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ssxb3Q6XAS4 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ssxb3Q6XAS4 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ssxb3Q6XAS4 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ssxb3Q6XAS4 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ssxb3Q6XAS4 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ssxb3Q6XAS4 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ssxb3Q6XAS4 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ssxb3Q6XAS4 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ssxb3Q6XAS4 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ssxb3Q6XAS4 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ssxb3Q6XAS4 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ssxb3Q6XAS4 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ssxb3Q6XAS4 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ssxb3Q6XAS4 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ssxb3Q6XAS4 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ssxb3Q6XAS4 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ssxb3Q6XAS4 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ssxb3Q6XAS4 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ssxb3Q6XAS4 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ssxb3Q6XAS4 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ssxb3Q6XAS4 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Ssxb3Q6XAS4 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Ssxb3Q6XAS4 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ssxb3Q6XAS4 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ssxb3Q6XAS4 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ssxb3Q6XAS4 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ssxb3Q6XAS4 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ssxb3Q6XAS4 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Ssxb3Q6XAS4 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ssxb3Q6XAS4 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ssxb3Q6XAS4 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ssxb3Q6XAS4 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ssxb3Q6XAS4 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ssxb3Q6XAS4 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ssxb3Q6XAS4 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ssxb3Q6XAS4 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ssxb3Q6XAS4 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ssxb3Q6XAS4 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ssxb3Q6XAS4 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ssxb3Q6XAS4 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ssxb3Q6XAS4 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ssxb3Q6XAS4 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ssxb3Q6XAS4 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ssxb3Q6XAS4 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Ssxb3Q6XAS4 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ssxb3Q6XAS4 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ssxb3Q6XAS4 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ssxb3Q6XAS4 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ssxb3Q6XAS4 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ssxb3Q6XAS4 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ssxb3Q6XAS4 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ssxb3Q6XAS4 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ssxb3Q6XAS4 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ssxb3Q6XAS4 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ssxb3Q6XAS4 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ssxb3Q6XAS4 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ssxb3Q6XAS4 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ssxb3Q6XAS4 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ssxb3Q6XAS4 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ssxb3Q6XAS4 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.4 ms