Protein–RNA interactions for Protein: Q6XAS2

Ssxb5, MCG68109, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssxb5Q6XAS2 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ssxb5Q6XAS2 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ssxb5Q6XAS2 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ssxb5Q6XAS2 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ssxb5Q6XAS2 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ssxb5Q6XAS2 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
Ssxb5Q6XAS2 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ssxb5Q6XAS2 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ssxb5Q6XAS2 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ssxb5Q6XAS2 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ssxb5Q6XAS2 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ssxb5Q6XAS2 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Ssxb5Q6XAS2 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ssxb5Q6XAS2 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ssxb5Q6XAS2 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ssxb5Q6XAS2 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ssxb5Q6XAS2 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ssxb5Q6XAS2 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ssxb5Q6XAS2 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ssxb5Q6XAS2 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ssxb5Q6XAS2 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ssxb5Q6XAS2 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ssxb5Q6XAS2 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Ssxb5Q6XAS2 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ssxb5Q6XAS2 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ssxb5Q6XAS2 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ssxb5Q6XAS2 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ssxb5Q6XAS2 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ssxb5Q6XAS2 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ssxb5Q6XAS2 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ssxb5Q6XAS2 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ssxb5Q6XAS2 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ssxb5Q6XAS2 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ssxb5Q6XAS2 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ssxb5Q6XAS2 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ssxb5Q6XAS2 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ssxb5Q6XAS2 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ssxb5Q6XAS2 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ssxb5Q6XAS2 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ssxb5Q6XAS2 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ssxb5Q6XAS2 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ssxb5Q6XAS2 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ssxb5Q6XAS2 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ssxb5Q6XAS2 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ssxb5Q6XAS2 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ssxb5Q6XAS2 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ssxb5Q6XAS2 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ssxb5Q6XAS2 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ssxb5Q6XAS2 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ssxb5Q6XAS2 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ssxb5Q6XAS2 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ssxb5Q6XAS2 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ssxb5Q6XAS2 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ssxb5Q6XAS2 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ssxb5Q6XAS2 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ssxb5Q6XAS2 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ssxb5Q6XAS2 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ssxb5Q6XAS2 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ssxb5Q6XAS2 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ssxb5Q6XAS2 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ssxb5Q6XAS2 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ssxb5Q6XAS2 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ssxb5Q6XAS2 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ssxb5Q6XAS2 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ssxb5Q6XAS2 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ssxb5Q6XAS2 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ssxb5Q6XAS2 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ssxb5Q6XAS2 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ssxb5Q6XAS2 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ssxb5Q6XAS2 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ssxb5Q6XAS2 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ssxb5Q6XAS2 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ssxb5Q6XAS2 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ssxb5Q6XAS2 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ssxb5Q6XAS2 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ssxb5Q6XAS2 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ssxb5Q6XAS2 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ssxb5Q6XAS2 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ssxb5Q6XAS2 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ssxb5Q6XAS2 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ssxb5Q6XAS2 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ssxb5Q6XAS2 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ssxb5Q6XAS2 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ssxb5Q6XAS2 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ssxb5Q6XAS2 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ssxb5Q6XAS2 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ssxb5Q6XAS2 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ssxb5Q6XAS2 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ssxb5Q6XAS2 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ssxb5Q6XAS2 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ssxb5Q6XAS2 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ssxb5Q6XAS2 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ssxb5Q6XAS2 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ssxb5Q6XAS2 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ssxb5Q6XAS2 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ssxb5Q6XAS2 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ssxb5Q6XAS2 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ssxb5Q6XAS2 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ssxb5Q6XAS2 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ssxb5Q6XAS2 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.1 ms