Protein–RNA interactions for Protein: Q6RHW0

Krt9, Keratin, type I cytoskeletal 9, mousemouse

Predictions only

Length 743 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt9Q6RHW0 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Krt9Q6RHW0 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Krt9Q6RHW0 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Krt9Q6RHW0 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Krt9Q6RHW0 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Krt9Q6RHW0 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Krt9Q6RHW0 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
Krt9Q6RHW0 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Krt9Q6RHW0 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Krt9Q6RHW0 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
Krt9Q6RHW0 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Krt9Q6RHW0 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Krt9Q6RHW0 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Krt9Q6RHW0 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Krt9Q6RHW0 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Krt9Q6RHW0 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Krt9Q6RHW0 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Krt9Q6RHW0 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Krt9Q6RHW0 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Krt9Q6RHW0 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Krt9Q6RHW0 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Krt9Q6RHW0 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Krt9Q6RHW0 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Krt9Q6RHW0 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Krt9Q6RHW0 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Krt9Q6RHW0 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Krt9Q6RHW0 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Krt9Q6RHW0 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Krt9Q6RHW0 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Krt9Q6RHW0 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Krt9Q6RHW0 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Krt9Q6RHW0 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Krt9Q6RHW0 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Krt9Q6RHW0 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Krt9Q6RHW0 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Krt9Q6RHW0 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Krt9Q6RHW0 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Krt9Q6RHW0 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Krt9Q6RHW0 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Krt9Q6RHW0 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Krt9Q6RHW0 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Krt9Q6RHW0 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Krt9Q6RHW0 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Krt9Q6RHW0 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Krt9Q6RHW0 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Krt9Q6RHW0 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Krt9Q6RHW0 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Krt9Q6RHW0 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Krt9Q6RHW0 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Krt9Q6RHW0 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Krt9Q6RHW0 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Krt9Q6RHW0 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Krt9Q6RHW0 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Krt9Q6RHW0 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Krt9Q6RHW0 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Krt9Q6RHW0 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Krt9Q6RHW0 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Krt9Q6RHW0 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Krt9Q6RHW0 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Krt9Q6RHW0 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Krt9Q6RHW0 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Krt9Q6RHW0 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Krt9Q6RHW0 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Krt9Q6RHW0 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Krt9Q6RHW0 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Krt9Q6RHW0 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Krt9Q6RHW0 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Krt9Q6RHW0 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Krt9Q6RHW0 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Krt9Q6RHW0 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
Krt9Q6RHW0 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Krt9Q6RHW0 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Krt9Q6RHW0 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Krt9Q6RHW0 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Krt9Q6RHW0 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Krt9Q6RHW0 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
Krt9Q6RHW0 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Krt9Q6RHW0 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Krt9Q6RHW0 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Krt9Q6RHW0 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Krt9Q6RHW0 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Krt9Q6RHW0 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Krt9Q6RHW0 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Krt9Q6RHW0 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Krt9Q6RHW0 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Krt9Q6RHW0 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Krt9Q6RHW0 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Krt9Q6RHW0 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Krt9Q6RHW0 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Krt9Q6RHW0 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Krt9Q6RHW0 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Krt9Q6RHW0 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Krt9Q6RHW0 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Krt9Q6RHW0 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Krt9Q6RHW0 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
Krt9Q6RHW0 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Krt9Q6RHW0 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Krt9Q6RHW0 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
Krt9Q6RHW0 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
Krt9Q6RHW0 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms