Protein–RNA interactions for Protein: Q6R5N8

Tlr13, Toll-like receptor 13, mousemouse

Predictions only

Length 991 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlr13Q6R5N8 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Tlr13Q6R5N8 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.68
Tlr13Q6R5N8 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Tlr13Q6R5N8 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Tlr13Q6R5N8 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Tlr13Q6R5N8 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Tlr13Q6R5N8 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Tlr13Q6R5N8 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Tlr13Q6R5N8 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Tlr13Q6R5N8 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Tlr13Q6R5N8 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Tlr13Q6R5N8 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Tlr13Q6R5N8 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Tlr13Q6R5N8 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Tlr13Q6R5N8 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Tlr13Q6R5N8 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Tlr13Q6R5N8 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Tlr13Q6R5N8 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Tlr13Q6R5N8 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Tlr13Q6R5N8 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Tlr13Q6R5N8 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Tlr13Q6R5N8 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Tlr13Q6R5N8 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Tlr13Q6R5N8 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Tlr13Q6R5N8 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Tlr13Q6R5N8 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Tlr13Q6R5N8 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Tlr13Q6R5N8 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Tlr13Q6R5N8 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Tlr13Q6R5N8 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Tlr13Q6R5N8 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Tlr13Q6R5N8 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Tlr13Q6R5N8 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Tlr13Q6R5N8 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Tlr13Q6R5N8 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Tlr13Q6R5N8 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Tlr13Q6R5N8 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Tlr13Q6R5N8 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Tlr13Q6R5N8 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Tlr13Q6R5N8 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Tlr13Q6R5N8 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Tlr13Q6R5N8 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Tlr13Q6R5N8 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Tlr13Q6R5N8 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
Tlr13Q6R5N8 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
Tlr13Q6R5N8 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Tlr13Q6R5N8 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Tlr13Q6R5N8 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Tlr13Q6R5N8 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Tlr13Q6R5N8 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Tlr13Q6R5N8 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Tlr13Q6R5N8 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Tlr13Q6R5N8 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Tlr13Q6R5N8 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Tlr13Q6R5N8 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Tlr13Q6R5N8 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Tlr13Q6R5N8 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Tlr13Q6R5N8 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Tlr13Q6R5N8 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Tlr13Q6R5N8 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Tlr13Q6R5N8 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Tlr13Q6R5N8 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Tlr13Q6R5N8 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Tlr13Q6R5N8 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Tlr13Q6R5N8 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Tlr13Q6R5N8 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Tlr13Q6R5N8 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Tlr13Q6R5N8 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Tlr13Q6R5N8 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Tlr13Q6R5N8 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Tlr13Q6R5N8 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Tlr13Q6R5N8 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Tlr13Q6R5N8 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Tlr13Q6R5N8 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Tlr13Q6R5N8 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Tlr13Q6R5N8 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Tlr13Q6R5N8 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Tlr13Q6R5N8 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Tlr13Q6R5N8 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Tlr13Q6R5N8 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Tlr13Q6R5N8 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Tlr13Q6R5N8 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Tlr13Q6R5N8 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Tlr13Q6R5N8 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Tlr13Q6R5N8 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Tlr13Q6R5N8 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Tlr13Q6R5N8 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Tlr13Q6R5N8 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Tlr13Q6R5N8 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Tlr13Q6R5N8 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Tlr13Q6R5N8 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Tlr13Q6R5N8 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Tlr13Q6R5N8 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Tlr13Q6R5N8 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Tlr13Q6R5N8 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Tlr13Q6R5N8 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Tlr13Q6R5N8 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Tlr13Q6R5N8 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Tlr13Q6R5N8 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Tlr13Q6R5N8 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.7 ms