Protein–RNA interactions for Protein: Q6PFE3

Rad54b, DNA repair and recombination protein RAD54B, mousemouse

Predictions only

Length 886 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad54bQ6PFE3 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Rad54bQ6PFE3 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Rad54bQ6PFE3 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Rad54bQ6PFE3 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Rad54bQ6PFE3 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Rad54bQ6PFE3 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Rad54bQ6PFE3 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Rad54bQ6PFE3 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Rad54bQ6PFE3 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Rad54bQ6PFE3 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Rad54bQ6PFE3 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Rad54bQ6PFE3 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Rad54bQ6PFE3 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Rad54bQ6PFE3 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Rad54bQ6PFE3 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Rad54bQ6PFE3 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Rad54bQ6PFE3 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Rad54bQ6PFE3 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Rad54bQ6PFE3 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Rad54bQ6PFE3 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Rad54bQ6PFE3 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Rad54bQ6PFE3 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Rad54bQ6PFE3 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Rad54bQ6PFE3 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Rad54bQ6PFE3 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Rad54bQ6PFE3 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Rad54bQ6PFE3 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Rad54bQ6PFE3 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Rad54bQ6PFE3 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Rad54bQ6PFE3 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Rad54bQ6PFE3 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Rad54bQ6PFE3 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Rad54bQ6PFE3 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Rad54bQ6PFE3 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Rad54bQ6PFE3 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Rad54bQ6PFE3 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Rad54bQ6PFE3 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Rad54bQ6PFE3 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Rad54bQ6PFE3 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Rad54bQ6PFE3 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Rad54bQ6PFE3 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Rad54bQ6PFE3 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Rad54bQ6PFE3 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Rad54bQ6PFE3 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Rad54bQ6PFE3 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Rad54bQ6PFE3 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Rad54bQ6PFE3 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Rad54bQ6PFE3 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Rad54bQ6PFE3 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Rad54bQ6PFE3 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Rad54bQ6PFE3 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Rad54bQ6PFE3 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Rad54bQ6PFE3 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Rad54bQ6PFE3 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Rad54bQ6PFE3 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Rad54bQ6PFE3 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Rad54bQ6PFE3 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Rad54bQ6PFE3 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Rad54bQ6PFE3 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Rad54bQ6PFE3 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Rad54bQ6PFE3 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Rad54bQ6PFE3 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Rad54bQ6PFE3 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Rad54bQ6PFE3 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Rad54bQ6PFE3 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Rad54bQ6PFE3 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Rad54bQ6PFE3 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Rad54bQ6PFE3 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Rad54bQ6PFE3 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Rad54bQ6PFE3 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Rad54bQ6PFE3 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Rad54bQ6PFE3 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Rad54bQ6PFE3 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Rad54bQ6PFE3 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Rad54bQ6PFE3 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Rad54bQ6PFE3 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Rad54bQ6PFE3 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rad54bQ6PFE3 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Rad54bQ6PFE3 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Rad54bQ6PFE3 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Rad54bQ6PFE3 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Rad54bQ6PFE3 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rad54bQ6PFE3 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rad54bQ6PFE3 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rad54bQ6PFE3 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rad54bQ6PFE3 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Rad54bQ6PFE3 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Rad54bQ6PFE3 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Rad54bQ6PFE3 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Rad54bQ6PFE3 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Rad54bQ6PFE3 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Rad54bQ6PFE3 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Rad54bQ6PFE3 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Rad54bQ6PFE3 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Rad54bQ6PFE3 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Rad54bQ6PFE3 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Rad54bQ6PFE3 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Rad54bQ6PFE3 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Rad54bQ6PFE3 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rad54bQ6PFE3 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms