Protein–RNA interactions for Protein: Q6PEM6

Gramd2b, GRAM domain-containing protein 2B, mousemouse

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gramd2bQ6PEM6 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gramd2bQ6PEM6 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gramd2bQ6PEM6 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gramd2bQ6PEM6 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gramd2bQ6PEM6 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gramd2bQ6PEM6 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gramd2bQ6PEM6 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Gramd2bQ6PEM6 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gramd2bQ6PEM6 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gramd2bQ6PEM6 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Gramd2bQ6PEM6 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Gramd2bQ6PEM6 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Gramd2bQ6PEM6 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Gramd2bQ6PEM6 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Gramd2bQ6PEM6 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gramd2bQ6PEM6 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gramd2bQ6PEM6 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gramd2bQ6PEM6 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gramd2bQ6PEM6 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gramd2bQ6PEM6 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gramd2bQ6PEM6 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gramd2bQ6PEM6 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gramd2bQ6PEM6 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gramd2bQ6PEM6 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gramd2bQ6PEM6 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gramd2bQ6PEM6 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gramd2bQ6PEM6 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gramd2bQ6PEM6 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gramd2bQ6PEM6 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Gramd2bQ6PEM6 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Gramd2bQ6PEM6 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Gramd2bQ6PEM6 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gramd2bQ6PEM6 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gramd2bQ6PEM6 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gramd2bQ6PEM6 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gramd2bQ6PEM6 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gramd2bQ6PEM6 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gramd2bQ6PEM6 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gramd2bQ6PEM6 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gramd2bQ6PEM6 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gramd2bQ6PEM6 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gramd2bQ6PEM6 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gramd2bQ6PEM6 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gramd2bQ6PEM6 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gramd2bQ6PEM6 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gramd2bQ6PEM6 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gramd2bQ6PEM6 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Gramd2bQ6PEM6 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Gramd2bQ6PEM6 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Gramd2bQ6PEM6 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Gramd2bQ6PEM6 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Gramd2bQ6PEM6 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gramd2bQ6PEM6 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gramd2bQ6PEM6 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gramd2bQ6PEM6 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gramd2bQ6PEM6 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Gramd2bQ6PEM6 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Gramd2bQ6PEM6 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gramd2bQ6PEM6 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gramd2bQ6PEM6 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gramd2bQ6PEM6 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gramd2bQ6PEM6 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gramd2bQ6PEM6 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gramd2bQ6PEM6 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gramd2bQ6PEM6 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gramd2bQ6PEM6 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gramd2bQ6PEM6 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gramd2bQ6PEM6 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gramd2bQ6PEM6 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gramd2bQ6PEM6 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gramd2bQ6PEM6 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Gramd2bQ6PEM6 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Gramd2bQ6PEM6 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Gramd2bQ6PEM6 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Gramd2bQ6PEM6 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Gramd2bQ6PEM6 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Gramd2bQ6PEM6 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gramd2bQ6PEM6 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gramd2bQ6PEM6 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gramd2bQ6PEM6 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gramd2bQ6PEM6 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gramd2bQ6PEM6 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gramd2bQ6PEM6 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gramd2bQ6PEM6 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gramd2bQ6PEM6 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gramd2bQ6PEM6 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gramd2bQ6PEM6 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gramd2bQ6PEM6 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gramd2bQ6PEM6 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gramd2bQ6PEM6 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gramd2bQ6PEM6 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gramd2bQ6PEM6 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gramd2bQ6PEM6 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gramd2bQ6PEM6 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Gramd2bQ6PEM6 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gramd2bQ6PEM6 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gramd2bQ6PEM6 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gramd2bQ6PEM6 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gramd2bQ6PEM6 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gramd2bQ6PEM6 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 111.4 ms