Protein–RNA interactions for Protein: Q6PAV2

Herc4, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC4, mousemouse

Predictions only

Length 1,057 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Herc4Q6PAV2 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Herc4Q6PAV2 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Herc4Q6PAV2 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Herc4Q6PAV2 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Herc4Q6PAV2 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Herc4Q6PAV2 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Herc4Q6PAV2 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Herc4Q6PAV2 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Herc4Q6PAV2 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Herc4Q6PAV2 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Herc4Q6PAV2 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Herc4Q6PAV2 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Herc4Q6PAV2 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Herc4Q6PAV2 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Herc4Q6PAV2 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Herc4Q6PAV2 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Herc4Q6PAV2 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Herc4Q6PAV2 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Herc4Q6PAV2 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Herc4Q6PAV2 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Herc4Q6PAV2 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Herc4Q6PAV2 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Herc4Q6PAV2 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Herc4Q6PAV2 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Herc4Q6PAV2 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Herc4Q6PAV2 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
Herc4Q6PAV2 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Herc4Q6PAV2 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Herc4Q6PAV2 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Herc4Q6PAV2 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
Herc4Q6PAV2 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Herc4Q6PAV2 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Herc4Q6PAV2 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Herc4Q6PAV2 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Herc4Q6PAV2 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Herc4Q6PAV2 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Herc4Q6PAV2 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Herc4Q6PAV2 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Herc4Q6PAV2 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Herc4Q6PAV2 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Herc4Q6PAV2 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Herc4Q6PAV2 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Herc4Q6PAV2 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
Herc4Q6PAV2 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Herc4Q6PAV2 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
Herc4Q6PAV2 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Herc4Q6PAV2 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Herc4Q6PAV2 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Herc4Q6PAV2 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Herc4Q6PAV2 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Herc4Q6PAV2 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Herc4Q6PAV2 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Herc4Q6PAV2 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Herc4Q6PAV2 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
Herc4Q6PAV2 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Herc4Q6PAV2 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Herc4Q6PAV2 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Herc4Q6PAV2 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
Herc4Q6PAV2 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
Herc4Q6PAV2 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Herc4Q6PAV2 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Herc4Q6PAV2 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Herc4Q6PAV2 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
Herc4Q6PAV2 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
Herc4Q6PAV2 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Herc4Q6PAV2 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Herc4Q6PAV2 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Herc4Q6PAV2 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Herc4Q6PAV2 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Herc4Q6PAV2 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Herc4Q6PAV2 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Herc4Q6PAV2 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Herc4Q6PAV2 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Herc4Q6PAV2 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Herc4Q6PAV2 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Herc4Q6PAV2 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Herc4Q6PAV2 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Herc4Q6PAV2 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Herc4Q6PAV2 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Herc4Q6PAV2 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Herc4Q6PAV2 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Herc4Q6PAV2 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Herc4Q6PAV2 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Herc4Q6PAV2 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Herc4Q6PAV2 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Herc4Q6PAV2 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Herc4Q6PAV2 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
Herc4Q6PAV2 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Herc4Q6PAV2 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Herc4Q6PAV2 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Herc4Q6PAV2 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Herc4Q6PAV2 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Herc4Q6PAV2 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Herc4Q6PAV2 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Herc4Q6PAV2 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Herc4Q6PAV2 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Herc4Q6PAV2 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Herc4Q6PAV2 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Herc4Q6PAV2 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Herc4Q6PAV2 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.1 ms