Protein–RNA interactions for Protein: Q6PAQ9

Prrg3, Transmembrane gamma-carboxyglutamic acid protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 231 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrg3Q6PAQ9 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Prrg3Q6PAQ9 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Prrg3Q6PAQ9 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Prrg3Q6PAQ9 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Prrg3Q6PAQ9 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Prrg3Q6PAQ9 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Prrg3Q6PAQ9 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Prrg3Q6PAQ9 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Prrg3Q6PAQ9 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Prrg3Q6PAQ9 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Prrg3Q6PAQ9 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Prrg3Q6PAQ9 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Prrg3Q6PAQ9 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Prrg3Q6PAQ9 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Prrg3Q6PAQ9 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Prrg3Q6PAQ9 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Prrg3Q6PAQ9 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Prrg3Q6PAQ9 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Prrg3Q6PAQ9 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Prrg3Q6PAQ9 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Prrg3Q6PAQ9 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Prrg3Q6PAQ9 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Prrg3Q6PAQ9 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Prrg3Q6PAQ9 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Prrg3Q6PAQ9 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Prrg3Q6PAQ9 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Prrg3Q6PAQ9 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Prrg3Q6PAQ9 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Prrg3Q6PAQ9 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Prrg3Q6PAQ9 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Prrg3Q6PAQ9 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Prrg3Q6PAQ9 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Prrg3Q6PAQ9 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Prrg3Q6PAQ9 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Prrg3Q6PAQ9 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Prrg3Q6PAQ9 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Prrg3Q6PAQ9 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Prrg3Q6PAQ9 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Prrg3Q6PAQ9 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Prrg3Q6PAQ9 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Prrg3Q6PAQ9 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Prrg3Q6PAQ9 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Prrg3Q6PAQ9 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Prrg3Q6PAQ9 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Prrg3Q6PAQ9 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Prrg3Q6PAQ9 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Prrg3Q6PAQ9 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Prrg3Q6PAQ9 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Prrg3Q6PAQ9 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Prrg3Q6PAQ9 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Prrg3Q6PAQ9 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Prrg3Q6PAQ9 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Prrg3Q6PAQ9 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Prrg3Q6PAQ9 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Prrg3Q6PAQ9 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Prrg3Q6PAQ9 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Prrg3Q6PAQ9 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Prrg3Q6PAQ9 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Prrg3Q6PAQ9 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Prrg3Q6PAQ9 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Prrg3Q6PAQ9 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Prrg3Q6PAQ9 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Prrg3Q6PAQ9 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Prrg3Q6PAQ9 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Prrg3Q6PAQ9 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Prrg3Q6PAQ9 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Prrg3Q6PAQ9 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Prrg3Q6PAQ9 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Prrg3Q6PAQ9 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Prrg3Q6PAQ9 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Prrg3Q6PAQ9 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Prrg3Q6PAQ9 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Prrg3Q6PAQ9 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Prrg3Q6PAQ9 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Prrg3Q6PAQ9 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Prrg3Q6PAQ9 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Prrg3Q6PAQ9 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Prrg3Q6PAQ9 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Prrg3Q6PAQ9 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Prrg3Q6PAQ9 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Prrg3Q6PAQ9 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Prrg3Q6PAQ9 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Prrg3Q6PAQ9 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Prrg3Q6PAQ9 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Prrg3Q6PAQ9 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Prrg3Q6PAQ9 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Prrg3Q6PAQ9 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Prrg3Q6PAQ9 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Prrg3Q6PAQ9 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Prrg3Q6PAQ9 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Prrg3Q6PAQ9 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Prrg3Q6PAQ9 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Prrg3Q6PAQ9 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Prrg3Q6PAQ9 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Prrg3Q6PAQ9 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Prrg3Q6PAQ9 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Prrg3Q6PAQ9 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Prrg3Q6PAQ9 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Prrg3Q6PAQ9 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Prrg3Q6PAQ9 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms