Protein–RNA interactions for Protein: Q6P5H6

Frmd5, FERM domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 517 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Frmd5Q6P5H6 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Frmd5Q6P5H6 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Frmd5Q6P5H6 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Frmd5Q6P5H6 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Frmd5Q6P5H6 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Frmd5Q6P5H6 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Frmd5Q6P5H6 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Frmd5Q6P5H6 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Frmd5Q6P5H6 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Frmd5Q6P5H6 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Frmd5Q6P5H6 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Frmd5Q6P5H6 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Frmd5Q6P5H6 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Frmd5Q6P5H6 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Frmd5Q6P5H6 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Frmd5Q6P5H6 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Frmd5Q6P5H6 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Frmd5Q6P5H6 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Frmd5Q6P5H6 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Frmd5Q6P5H6 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Frmd5Q6P5H6 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Frmd5Q6P5H6 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Frmd5Q6P5H6 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Frmd5Q6P5H6 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Frmd5Q6P5H6 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Frmd5Q6P5H6 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Frmd5Q6P5H6 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Frmd5Q6P5H6 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Frmd5Q6P5H6 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Frmd5Q6P5H6 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Frmd5Q6P5H6 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Frmd5Q6P5H6 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Frmd5Q6P5H6 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Frmd5Q6P5H6 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Frmd5Q6P5H6 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Frmd5Q6P5H6 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Frmd5Q6P5H6 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Frmd5Q6P5H6 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Frmd5Q6P5H6 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Frmd5Q6P5H6 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Frmd5Q6P5H6 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Frmd5Q6P5H6 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Frmd5Q6P5H6 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Frmd5Q6P5H6 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Frmd5Q6P5H6 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Frmd5Q6P5H6 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Frmd5Q6P5H6 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Frmd5Q6P5H6 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Frmd5Q6P5H6 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Frmd5Q6P5H6 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Frmd5Q6P5H6 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Frmd5Q6P5H6 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Frmd5Q6P5H6 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
Frmd5Q6P5H6 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Frmd5Q6P5H6 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Frmd5Q6P5H6 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Frmd5Q6P5H6 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Frmd5Q6P5H6 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Frmd5Q6P5H6 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Frmd5Q6P5H6 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Frmd5Q6P5H6 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Frmd5Q6P5H6 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Frmd5Q6P5H6 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Frmd5Q6P5H6 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Frmd5Q6P5H6 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Frmd5Q6P5H6 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Frmd5Q6P5H6 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Frmd5Q6P5H6 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Frmd5Q6P5H6 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Frmd5Q6P5H6 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Frmd5Q6P5H6 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Frmd5Q6P5H6 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Frmd5Q6P5H6 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Frmd5Q6P5H6 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Frmd5Q6P5H6 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Frmd5Q6P5H6 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Frmd5Q6P5H6 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Frmd5Q6P5H6 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Frmd5Q6P5H6 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Frmd5Q6P5H6 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Frmd5Q6P5H6 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Frmd5Q6P5H6 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Frmd5Q6P5H6 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Frmd5Q6P5H6 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Frmd5Q6P5H6 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Frmd5Q6P5H6 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Frmd5Q6P5H6 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Frmd5Q6P5H6 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Frmd5Q6P5H6 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
Frmd5Q6P5H6 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
Frmd5Q6P5H6 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Frmd5Q6P5H6 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Frmd5Q6P5H6 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Frmd5Q6P5H6 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Frmd5Q6P5H6 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Frmd5Q6P5H6 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Frmd5Q6P5H6 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Frmd5Q6P5H6 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Frmd5Q6P5H6 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Frmd5Q6P5H6 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.8 ms