Protein–RNA interactions for Protein: Q6P5E6

Gga2, ADP-ribosylation factor-binding protein GGA2, mousemouse

Predictions only

Length 603 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gga2Q6P5E6 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Gga2Q6P5E6 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Gga2Q6P5E6 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Gga2Q6P5E6 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Gga2Q6P5E6 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Gga2Q6P5E6 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Gga2Q6P5E6 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Gga2Q6P5E6 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Gga2Q6P5E6 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Gga2Q6P5E6 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Gga2Q6P5E6 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Gga2Q6P5E6 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Gga2Q6P5E6 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Gga2Q6P5E6 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Gga2Q6P5E6 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Gga2Q6P5E6 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Gga2Q6P5E6 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Gga2Q6P5E6 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Gga2Q6P5E6 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Gga2Q6P5E6 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Gga2Q6P5E6 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Gga2Q6P5E6 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Gga2Q6P5E6 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Gga2Q6P5E6 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Gga2Q6P5E6 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Gga2Q6P5E6 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Gga2Q6P5E6 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Gga2Q6P5E6 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Gga2Q6P5E6 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Gga2Q6P5E6 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Gga2Q6P5E6 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Gga2Q6P5E6 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Gga2Q6P5E6 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Gga2Q6P5E6 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Gga2Q6P5E6 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Gga2Q6P5E6 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Gga2Q6P5E6 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Gga2Q6P5E6 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Gga2Q6P5E6 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Gga2Q6P5E6 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Gga2Q6P5E6 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Gga2Q6P5E6 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Gga2Q6P5E6 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Gga2Q6P5E6 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Gga2Q6P5E6 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Gga2Q6P5E6 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Gga2Q6P5E6 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Gga2Q6P5E6 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Gga2Q6P5E6 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Gga2Q6P5E6 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Gga2Q6P5E6 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Gga2Q6P5E6 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Gga2Q6P5E6 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Gga2Q6P5E6 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Gga2Q6P5E6 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Gga2Q6P5E6 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Gga2Q6P5E6 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Gga2Q6P5E6 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Gga2Q6P5E6 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Gga2Q6P5E6 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Gga2Q6P5E6 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Gga2Q6P5E6 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Gga2Q6P5E6 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Gga2Q6P5E6 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Gga2Q6P5E6 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Gga2Q6P5E6 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Gga2Q6P5E6 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Gga2Q6P5E6 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Gga2Q6P5E6 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Gga2Q6P5E6 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Gga2Q6P5E6 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Gga2Q6P5E6 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Gga2Q6P5E6 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Gga2Q6P5E6 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Gga2Q6P5E6 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Gga2Q6P5E6 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Gga2Q6P5E6 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Gga2Q6P5E6 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Gga2Q6P5E6 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Gga2Q6P5E6 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Gga2Q6P5E6 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Gga2Q6P5E6 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Gga2Q6P5E6 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Gga2Q6P5E6 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Gga2Q6P5E6 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Gga2Q6P5E6 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Gga2Q6P5E6 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Gga2Q6P5E6 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Gga2Q6P5E6 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Gga2Q6P5E6 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Gga2Q6P5E6 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Gga2Q6P5E6 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Gga2Q6P5E6 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Gga2Q6P5E6 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Gga2Q6P5E6 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Gga2Q6P5E6 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Gga2Q6P5E6 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Gga2Q6P5E6 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Gga2Q6P5E6 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Gga2Q6P5E6 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47 ms