Protein–RNA interactions for Protein: Q6P3A4

Vsig8, V-set and immunoglobulin domain-containing protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vsig8Q6P3A4 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Vsig8Q6P3A4 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Vsig8Q6P3A4 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Vsig8Q6P3A4 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Vsig8Q6P3A4 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Vsig8Q6P3A4 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Vsig8Q6P3A4 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Vsig8Q6P3A4 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Vsig8Q6P3A4 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Vsig8Q6P3A4 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Vsig8Q6P3A4 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Vsig8Q6P3A4 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Vsig8Q6P3A4 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Vsig8Q6P3A4 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Vsig8Q6P3A4 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Vsig8Q6P3A4 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Vsig8Q6P3A4 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Vsig8Q6P3A4 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Vsig8Q6P3A4 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Vsig8Q6P3A4 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Vsig8Q6P3A4 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Vsig8Q6P3A4 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Vsig8Q6P3A4 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Vsig8Q6P3A4 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Vsig8Q6P3A4 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Vsig8Q6P3A4 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Vsig8Q6P3A4 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Vsig8Q6P3A4 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Vsig8Q6P3A4 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Vsig8Q6P3A4 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Vsig8Q6P3A4 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Vsig8Q6P3A4 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Vsig8Q6P3A4 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Vsig8Q6P3A4 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Vsig8Q6P3A4 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Vsig8Q6P3A4 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Vsig8Q6P3A4 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Vsig8Q6P3A4 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Vsig8Q6P3A4 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Vsig8Q6P3A4 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Vsig8Q6P3A4 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Vsig8Q6P3A4 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Vsig8Q6P3A4 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Vsig8Q6P3A4 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Vsig8Q6P3A4 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Vsig8Q6P3A4 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Vsig8Q6P3A4 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Vsig8Q6P3A4 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Vsig8Q6P3A4 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Vsig8Q6P3A4 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Vsig8Q6P3A4 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Vsig8Q6P3A4 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Vsig8Q6P3A4 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Vsig8Q6P3A4 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Vsig8Q6P3A4 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Vsig8Q6P3A4 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Vsig8Q6P3A4 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Vsig8Q6P3A4 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Vsig8Q6P3A4 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Vsig8Q6P3A4 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Vsig8Q6P3A4 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Vsig8Q6P3A4 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Vsig8Q6P3A4 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Vsig8Q6P3A4 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Vsig8Q6P3A4 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Vsig8Q6P3A4 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Vsig8Q6P3A4 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Vsig8Q6P3A4 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Vsig8Q6P3A4 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Vsig8Q6P3A4 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Vsig8Q6P3A4 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Vsig8Q6P3A4 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Vsig8Q6P3A4 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Vsig8Q6P3A4 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Vsig8Q6P3A4 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Vsig8Q6P3A4 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Vsig8Q6P3A4 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Vsig8Q6P3A4 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Vsig8Q6P3A4 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Vsig8Q6P3A4 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Vsig8Q6P3A4 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Vsig8Q6P3A4 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Vsig8Q6P3A4 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Vsig8Q6P3A4 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Vsig8Q6P3A4 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Vsig8Q6P3A4 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Vsig8Q6P3A4 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Vsig8Q6P3A4 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Vsig8Q6P3A4 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Vsig8Q6P3A4 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Vsig8Q6P3A4 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Vsig8Q6P3A4 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Vsig8Q6P3A4 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Vsig8Q6P3A4 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Vsig8Q6P3A4 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Vsig8Q6P3A4 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Vsig8Q6P3A4 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Vsig8Q6P3A4 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Vsig8Q6P3A4 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Vsig8Q6P3A4 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.2 ms