Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1D7

Slx4, Structure-specific endonuclease subunit SLX4, mousemouse

Predictions only

Length 1,565 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slx4Q6P1D7 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC37.83■■■■□ 3.65
Slx4Q6P1D7 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC37.83■■■■□ 3.65
Slx4Q6P1D7 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC37.82■■■■□ 3.65
Slx4Q6P1D7 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.82■■■■□ 3.64
Slx4Q6P1D7 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC37.81■■■■□ 3.64
Slx4Q6P1D7 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.81■■■■□ 3.64
Slx4Q6P1D7 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.8■■■■□ 3.64
Slx4Q6P1D7 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC37.8■■■■□ 3.64
Slx4Q6P1D7 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.79■■■■□ 3.64
Slx4Q6P1D7 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.78■■■■□ 3.64
Slx4Q6P1D7 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC37.78■■■■□ 3.64
Slx4Q6P1D7 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.77■■■■□ 3.64
Slx4Q6P1D7 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.76■■■■□ 3.64
Slx4Q6P1D7 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC37.76■■■■□ 3.64
Slx4Q6P1D7 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.76■■■■□ 3.64
Slx4Q6P1D7 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.76■■■■□ 3.63
Slx4Q6P1D7 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.76■■■■□ 3.63
Slx4Q6P1D7 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC37.76■■■■□ 3.63
Slx4Q6P1D7 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.75■■■■□ 3.63
Slx4Q6P1D7 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.75■■■■□ 3.63
Slx4Q6P1D7 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC37.75■■■■□ 3.63
Slx4Q6P1D7 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.73■■■■□ 3.63
Slx4Q6P1D7 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.72■■■■□ 3.63
Slx4Q6P1D7 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.71■■■■□ 3.63
Slx4Q6P1D7 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC37.71■■■■□ 3.63
Slx4Q6P1D7 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.71■■■■□ 3.63
Slx4Q6P1D7 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC37.7■■■■□ 3.63
Slx4Q6P1D7 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.7■■■■□ 3.63
Slx4Q6P1D7 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.69■■■■□ 3.62
Slx4Q6P1D7 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.69■■■■□ 3.62
Slx4Q6P1D7 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC37.69■■■■□ 3.62
Slx4Q6P1D7 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.69■■■■□ 3.62
Slx4Q6P1D7 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.68■■■■□ 3.62
Slx4Q6P1D7 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.68■■■■□ 3.62
Slx4Q6P1D7 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC37.67■■■■□ 3.62
Slx4Q6P1D7 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC37.66■■■■□ 3.62
Slx4Q6P1D7 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.64■■■■□ 3.62
Slx4Q6P1D7 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC37.63■■■■□ 3.62
Slx4Q6P1D7 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.63■■■■□ 3.62
Slx4Q6P1D7 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.61■■■■□ 3.61
Slx4Q6P1D7 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC37.6■■■■□ 3.61
Slx4Q6P1D7 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.6■■■■□ 3.61
Slx4Q6P1D7 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC37.59■■■■□ 3.61
Slx4Q6P1D7 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.59■■■■□ 3.61
Slx4Q6P1D7 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.58■■■■□ 3.61
Slx4Q6P1D7 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC37.58■■■■□ 3.61
Slx4Q6P1D7 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC37.56■■■■□ 3.6
Slx4Q6P1D7 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.56■■■■□ 3.6
Slx4Q6P1D7 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.55■■■■□ 3.6
Slx4Q6P1D7 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.55■■■■□ 3.6
Slx4Q6P1D7 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.55■■■■□ 3.6
Slx4Q6P1D7 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.54■■■■□ 3.6
Slx4Q6P1D7 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.54■■■■□ 3.6
Slx4Q6P1D7 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.53■■■■□ 3.6
Slx4Q6P1D7 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC37.52■■■■□ 3.6
Slx4Q6P1D7 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC37.51■■■■□ 3.59
Slx4Q6P1D7 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.51■■■■□ 3.59
Slx4Q6P1D7 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC37.51■■■■□ 3.59
Slx4Q6P1D7 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.5■■■■□ 3.59
Slx4Q6P1D7 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.5■■■■□ 3.59
Slx4Q6P1D7 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC37.5■■■■□ 3.59
Slx4Q6P1D7 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.5■■■■□ 3.59
Slx4Q6P1D7 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC37.5■■■■□ 3.59
Slx4Q6P1D7 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC37.49■■■■□ 3.59
Slx4Q6P1D7 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC37.49■■■■□ 3.59
Slx4Q6P1D7 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.49■■■■□ 3.59
Slx4Q6P1D7 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC37.49■■■■□ 3.59
Slx4Q6P1D7 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC37.48■■■■□ 3.59
Slx4Q6P1D7 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.48■■■■□ 3.59
Slx4Q6P1D7 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC37.48■■■■□ 3.59
Slx4Q6P1D7 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC37.47■■■■□ 3.59
Slx4Q6P1D7 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC37.45■■■■□ 3.59
Slx4Q6P1D7 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.45■■■■□ 3.59
Slx4Q6P1D7 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.44■■■■□ 3.58
Slx4Q6P1D7 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC37.44■■■■□ 3.58
Slx4Q6P1D7 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.43■■■■□ 3.58
Slx4Q6P1D7 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC37.42■■■■□ 3.58
Slx4Q6P1D7 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.42■■■■□ 3.58
Slx4Q6P1D7 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.41■■■■□ 3.58
Slx4Q6P1D7 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.41■■■■□ 3.58
Slx4Q6P1D7 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.41■■■■□ 3.58
Slx4Q6P1D7 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC37.39■■■■□ 3.58
Slx4Q6P1D7 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.39■■■■□ 3.58
Slx4Q6P1D7 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.38■■■■□ 3.57
Slx4Q6P1D7 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC37.38■■■■□ 3.57
Slx4Q6P1D7 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.37■■■■□ 3.57
Slx4Q6P1D7 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC37.36■■■■□ 3.57
Slx4Q6P1D7 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC37.36■■■■□ 3.57
Slx4Q6P1D7 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC37.35■■■■□ 3.57
Slx4Q6P1D7 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.35■■■■□ 3.57
Slx4Q6P1D7 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.35■■■■□ 3.57
Slx4Q6P1D7 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.34■■■■□ 3.57
Slx4Q6P1D7 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC37.34■■■■□ 3.57
Slx4Q6P1D7 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.34■■■■□ 3.57
Slx4Q6P1D7 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.33■■■■□ 3.57
Slx4Q6P1D7 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC37.33■■■■□ 3.57
Slx4Q6P1D7 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC37.33■■■■□ 3.57
Slx4Q6P1D7 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC37.33■■■■□ 3.57
Slx4Q6P1D7 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC37.32■■■■□ 3.56
Slx4Q6P1D7 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.31■■■■□ 3.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms