Protein–RNA interactions for Protein: Q6NZN1

Pprc1, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma coactivator-related protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,644 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pprc1Q6NZN1 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC37.55■■■■□ 3.6
Pprc1Q6NZN1 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.55■■■■□ 3.6
Pprc1Q6NZN1 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.54■■■■□ 3.6
Pprc1Q6NZN1 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.53■■■■□ 3.6
Pprc1Q6NZN1 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC37.53■■■■□ 3.6
Pprc1Q6NZN1 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC37.53■■■■□ 3.6
Pprc1Q6NZN1 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.52■■■■□ 3.6
Pprc1Q6NZN1 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC37.52■■■■□ 3.6
Pprc1Q6NZN1 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.52■■■■□ 3.6
Pprc1Q6NZN1 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC37.51■■■■□ 3.6
Pprc1Q6NZN1 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC37.51■■■■□ 3.6
Pprc1Q6NZN1 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC37.51■■■■□ 3.6
Pprc1Q6NZN1 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC37.51■■■■□ 3.6
Pprc1Q6NZN1 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC37.51■■■■□ 3.6
Pprc1Q6NZN1 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.51■■■■□ 3.6
Pprc1Q6NZN1 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC37.5■■■■□ 3.59
Pprc1Q6NZN1 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.49■■■■□ 3.59
Pprc1Q6NZN1 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC37.49■■■■□ 3.59
Pprc1Q6NZN1 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC37.49■■■■□ 3.59
Pprc1Q6NZN1 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.48■■■■□ 3.59
Pprc1Q6NZN1 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.48■■■■□ 3.59
Pprc1Q6NZN1 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.47■■■■□ 3.59
Pprc1Q6NZN1 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC37.45■■■■□ 3.59
Pprc1Q6NZN1 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC37.44■■■■□ 3.58
Pprc1Q6NZN1 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC37.43■■■■□ 3.58
Pprc1Q6NZN1 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.43■■■■□ 3.58
Pprc1Q6NZN1 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC37.41■■■■□ 3.58
Pprc1Q6NZN1 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC37.4■■■■□ 3.58
Pprc1Q6NZN1 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.4■■■■□ 3.58
Pprc1Q6NZN1 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.39■■■■□ 3.58
Pprc1Q6NZN1 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.39■■■■□ 3.58
Pprc1Q6NZN1 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.38■■■■□ 3.57
Pprc1Q6NZN1 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.38■■■■□ 3.57
Pprc1Q6NZN1 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.37■■■■□ 3.57
Pprc1Q6NZN1 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC37.37■■■■□ 3.57
Pprc1Q6NZN1 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC37.36■■■■□ 3.57
Pprc1Q6NZN1 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC37.36■■■■□ 3.57
Pprc1Q6NZN1 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC37.36■■■■□ 3.57
Pprc1Q6NZN1 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.35■■■■□ 3.57
Pprc1Q6NZN1 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.35■■■■□ 3.57
Pprc1Q6NZN1 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC37.35■■■■□ 3.57
Pprc1Q6NZN1 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.34■■■■□ 3.57
Pprc1Q6NZN1 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC37.33■■■■□ 3.57
Pprc1Q6NZN1 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.32■■■■□ 3.57
Pprc1Q6NZN1 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC37.31■■■■□ 3.56
Pprc1Q6NZN1 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.31■■■■□ 3.56
Pprc1Q6NZN1 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC37.31■■■■□ 3.56
Pprc1Q6NZN1 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.29■■■■□ 3.56
Pprc1Q6NZN1 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.29■■■■□ 3.56
Pprc1Q6NZN1 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.28■■■■□ 3.56
Pprc1Q6NZN1 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.28■■■■□ 3.56
Pprc1Q6NZN1 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.28■■■■□ 3.56
Pprc1Q6NZN1 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.27■■■■□ 3.56
Pprc1Q6NZN1 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC37.27■■■■□ 3.56
Pprc1Q6NZN1 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.26■■■■□ 3.56
Pprc1Q6NZN1 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.25■■■■□ 3.55
Pprc1Q6NZN1 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.24■■■■□ 3.55
Pprc1Q6NZN1 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.24■■■■□ 3.55
Pprc1Q6NZN1 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC37.23■■■■□ 3.55
Pprc1Q6NZN1 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC37.23■■■■□ 3.55
Pprc1Q6NZN1 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.22■■■■□ 3.55
Pprc1Q6NZN1 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC37.22■■■■□ 3.55
Pprc1Q6NZN1 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC37.21■■■■□ 3.55
Pprc1Q6NZN1 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.2■■■■□ 3.55
Pprc1Q6NZN1 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.19■■■■□ 3.54
Pprc1Q6NZN1 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC37.19■■■■□ 3.54
Pprc1Q6NZN1 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.17■■■■□ 3.54
Pprc1Q6NZN1 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC37.17■■■■□ 3.54
Pprc1Q6NZN1 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC37.16■■■■□ 3.54
Pprc1Q6NZN1 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.16■■■■□ 3.54
Pprc1Q6NZN1 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.15■■■■□ 3.54
Pprc1Q6NZN1 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.14■■■■□ 3.54
Pprc1Q6NZN1 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC37.14■■■■□ 3.54
Pprc1Q6NZN1 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC37.14■■■■□ 3.54
Pprc1Q6NZN1 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC37.13■■■■□ 3.53
Pprc1Q6NZN1 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.13■■■■□ 3.53
Pprc1Q6NZN1 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC37.13■■■■□ 3.53
Pprc1Q6NZN1 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.12■■■■□ 3.53
Pprc1Q6NZN1 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.12■■■■□ 3.53
Pprc1Q6NZN1 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.12■■■■□ 3.53
Pprc1Q6NZN1 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC37.12■■■■□ 3.53
Pprc1Q6NZN1 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.11■■■■□ 3.53
Pprc1Q6NZN1 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC37.11■■■■□ 3.53
Pprc1Q6NZN1 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC37.09■■■■□ 3.53
Pprc1Q6NZN1 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC37.09■■■■□ 3.53
Pprc1Q6NZN1 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC37.08■■■■□ 3.53
Pprc1Q6NZN1 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.08■■■■□ 3.53
Pprc1Q6NZN1 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.08■■■■□ 3.53
Pprc1Q6NZN1 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC37.07■■■■□ 3.53
Pprc1Q6NZN1 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.07■■■■□ 3.52
Pprc1Q6NZN1 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC37.05■■■■□ 3.52
Pprc1Q6NZN1 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC37.03■■■■□ 3.52
Pprc1Q6NZN1 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.03■■■■□ 3.52
Pprc1Q6NZN1 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC37.03■■■■□ 3.52
Pprc1Q6NZN1 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.03■■■■□ 3.52
Pprc1Q6NZN1 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.01■■■■□ 3.52
Pprc1Q6NZN1 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.01■■■■□ 3.52
Pprc1Q6NZN1 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37■■■■□ 3.51
Pprc1Q6NZN1 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC37■■■■□ 3.51
Pprc1Q6NZN1 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC36.99■■■■□ 3.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.9 ms