Protein–RNA interactions for Protein: Q6NZA9

Taf9b, Transcription initiation factor TFIID subunit 9B, mousemouse

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf9bQ6NZA9 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Taf9bQ6NZA9 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Taf9bQ6NZA9 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Taf9bQ6NZA9 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Taf9bQ6NZA9 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Taf9bQ6NZA9 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Taf9bQ6NZA9 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Taf9bQ6NZA9 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Taf9bQ6NZA9 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Taf9bQ6NZA9 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Taf9bQ6NZA9 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Taf9bQ6NZA9 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Taf9bQ6NZA9 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Taf9bQ6NZA9 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Taf9bQ6NZA9 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Taf9bQ6NZA9 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Taf9bQ6NZA9 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Taf9bQ6NZA9 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Taf9bQ6NZA9 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Taf9bQ6NZA9 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Taf9bQ6NZA9 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Taf9bQ6NZA9 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Taf9bQ6NZA9 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Taf9bQ6NZA9 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Taf9bQ6NZA9 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Taf9bQ6NZA9 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Taf9bQ6NZA9 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Taf9bQ6NZA9 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Taf9bQ6NZA9 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Taf9bQ6NZA9 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Taf9bQ6NZA9 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Taf9bQ6NZA9 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Taf9bQ6NZA9 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Taf9bQ6NZA9 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Taf9bQ6NZA9 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Taf9bQ6NZA9 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Taf9bQ6NZA9 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Taf9bQ6NZA9 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Taf9bQ6NZA9 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Taf9bQ6NZA9 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Taf9bQ6NZA9 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Taf9bQ6NZA9 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Taf9bQ6NZA9 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Taf9bQ6NZA9 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Taf9bQ6NZA9 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Taf9bQ6NZA9 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Taf9bQ6NZA9 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Taf9bQ6NZA9 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Taf9bQ6NZA9 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Taf9bQ6NZA9 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Taf9bQ6NZA9 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Taf9bQ6NZA9 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Taf9bQ6NZA9 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Taf9bQ6NZA9 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Taf9bQ6NZA9 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Taf9bQ6NZA9 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Taf9bQ6NZA9 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Taf9bQ6NZA9 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Taf9bQ6NZA9 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Taf9bQ6NZA9 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Taf9bQ6NZA9 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Taf9bQ6NZA9 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Taf9bQ6NZA9 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Taf9bQ6NZA9 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Taf9bQ6NZA9 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Taf9bQ6NZA9 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Taf9bQ6NZA9 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Taf9bQ6NZA9 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Taf9bQ6NZA9 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Taf9bQ6NZA9 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Taf9bQ6NZA9 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Taf9bQ6NZA9 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Taf9bQ6NZA9 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Taf9bQ6NZA9 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Taf9bQ6NZA9 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Taf9bQ6NZA9 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Taf9bQ6NZA9 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Taf9bQ6NZA9 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Taf9bQ6NZA9 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Taf9bQ6NZA9 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Taf9bQ6NZA9 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Taf9bQ6NZA9 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Taf9bQ6NZA9 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Taf9bQ6NZA9 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Taf9bQ6NZA9 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Taf9bQ6NZA9 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Taf9bQ6NZA9 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Taf9bQ6NZA9 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Taf9bQ6NZA9 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Taf9bQ6NZA9 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Taf9bQ6NZA9 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Taf9bQ6NZA9 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Taf9bQ6NZA9 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Taf9bQ6NZA9 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Taf9bQ6NZA9 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Taf9bQ6NZA9 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Taf9bQ6NZA9 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Taf9bQ6NZA9 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Taf9bQ6NZA9 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Taf9bQ6NZA9 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms